More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0953 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 608 aa  667    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1470  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 		 607 aa  648    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 613 aa  643    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  56.11 
 
 		 598 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  52 
 
 		 602 aa  643    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 		 594 aa  644    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 		 608 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  55.48 
 
 		 599 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  54.67 
 
 		 600 aa  679    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  59.33 
 
 		 606 aa  734    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 		 614 aa  649    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  52.17 
 
 		 600 aa  635    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52 
 
 		 602 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 		 601 aa  666    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  51.72 
 
 		 612 aa  655    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  88.49 
 
 		 608 aa  1107    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 		 614 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 		 614 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  52.86 
 
 		 614 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  90.95 
 
 		 608 aa  1108    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  52.86 
 
 		 614 aa  648    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  53.88 
 
 		 608 aa  638    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  54.06 
 
 		 608 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  54.41 
 
 		 600 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52 
 
 		 602 aa  644    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  53.06 
 
 		 613 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  53.38 
 
 		 598 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  54.45 
 
 		 614 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  51.89 
 
 		 610 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 599 aa  650    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.78 
 
 		 596 aa  656    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  54.53 
 
 		 597 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  78.8 
 
 		 608 aa  973    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  57.07 
 
 		 602 aa  703    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  56.59 
 
 		 610 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  86.3 
 
 		 610 aa  1088    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  54.92 
 
 		 600 aa  663    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  86.14 
 
 		 608 aa  1087    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 		 602 aa  676    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 		 598 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 		 609 aa  642    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  52.68 
 
 		 600 aa  642    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 		 614 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  52.08 
 
 		 600 aa  643    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  54.24 
 
 		 598 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  56.07 
 
 		 597 aa  665    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  54.1 
 
 		 599 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  53.88 
 
 		 632 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 592 aa  642    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 		 614 aa  649    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  53.82 
 
 		 600 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  54.24 
 
 		 598 aa  654    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 603 aa  657    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  54.96 
 
 		 608 aa  686    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 604 aa  672    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  53.18 
 
 		 614 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  55.73 
 
 		 597 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  53.5 
 
 		 598 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  56.36 
 
 		 605 aa  715    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  52.51 
 
 		 605 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 		 593 aa  657    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  58.24 
 
 		 614 aa  743    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  52.7 
 
 		 614 aa  645    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  54.08 
 
 		 605 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 		 614 aa  641    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 		 614 aa  649    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  54.24 
 
 		 598 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 		 610 aa  688    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 		 610 aa  689    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  55.04 
 
 		 596 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 		 596 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  55.73 
 
 		 597 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  53.41 
 
 		 602 aa  651    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 		 596 aa  665    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  52.73 
 
 		 627 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  79.13 
 
 		 608 aa  986    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  52.7 
 
 		 614 aa  647    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 		 602 aa  647    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  58.98 
 
 		 616 aa  733    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  54 
 
 		 601 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 608 aa  1235    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  53 
 
 		 602 aa  645    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 		 601 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 		 615 aa  633  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 		 615 aa  633  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 		 608 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 		 608 aa  631  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 		 608 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 		 608 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 		 608 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 603 aa  631  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 		 608 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 		 608 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  52.89 
 
 		 608 aa  631  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  50.93 
 
 		 608 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  51.9 
 
 		 618 aa  629  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  52.73 
 
 		 608 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 		 608 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 608 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  51.39 
 
 		 614 aa  625  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>