More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1007 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  54.14 
 
 		 607 aa  680    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  54.14 
 
 		 607 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  58.78 
 
 		 609 aa  724    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  61.04 
 
 		 598 aa  754    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  54.89 
 
 		 606 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  53.6 
 
 		 599 aa  660    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  58.91 
 
 		 615 aa  751    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  56.93 
 
 		 606 aa  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  53.55 
 
 		 609 aa  662    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  55.76 
 
 		 606 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  59.08 
 
 		 614 aa  752    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 		 605 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  57.4 
 
 		 602 aa  717    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  59.61 
 
 		 613 aa  753    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  54.99 
 
 		 608 aa  659    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  58.31 
 
 		 603 aa  701    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  54.62 
 
 		 606 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  59.08 
 
 		 614 aa  752    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  59.08 
 
 		 614 aa  752    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  59.08 
 
 		 614 aa  751    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  57.96 
 
 		 608 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  57.02 
 
 		 608 aa  684    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  57.02 
 
 		 608 aa  685    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  54.95 
 
 		 606 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  54.68 
 
 		 615 aa  665    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  53.87 
 
 		 613 aa  673    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  55.52 
 
 		 650 aa  684    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  58.7 
 
 		 598 aa  726    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 		 606 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  52.04 
 
 		 614 aa  645    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 		 610 aa  708    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  54.38 
 
 		 614 aa  674    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.79 
 
 		 596 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  57.96 
 
 		 608 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  58.71 
 
 		 609 aa  705    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  54.06 
 
 		 606 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  51.92 
 
 		 606 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  61.86 
 
 		 602 aa  784    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  57.62 
 
 		 608 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  58.28 
 
 		 610 aa  747    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  59.14 
 
 		 600 aa  748    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  58.77 
 
 		 608 aa  754    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  61.3 
 
 		 602 aa  750    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  59.87 
 
 		 598 aa  746    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  55.2 
 
 		 614 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  54.64 
 
 		 607 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  59.08 
 
 		 614 aa  752    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  56.07 
 
 		 600 aa  686    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  60.62 
 
 		 598 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  61.13 
 
 		 597 aa  744    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  56.54 
 
 		 603 aa  718    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  54.43 
 
 		 613 aa  658    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  63.61 
 
 		 592 aa  784    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  57.45 
 
 		 608 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  56.91 
 
 		 615 aa  713    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  54.84 
 
 		 620 aa  685    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  54.02 
 
 		 614 aa  667    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  52.2 
 
 		 614 aa  647    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 606 aa  647    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  53.5 
 
 		 608 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 		 607 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  57.58 
 
 		 602 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2429  GTP-binding protein TypA  52.32 
 
 		 607 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.456233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  56.41 
 
 		 608 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  58.31 
 
 		 603 aa  697    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  52.97 
 
 		 608 aa  663    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 		 627 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  55.17 
 
 		 615 aa  674    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  56.11 
 
 		 607 aa  673    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  60.8 
 
 		 605 aa  750    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  60.3 
 
 		 593 aa  737    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 		 606 aa  653    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  53.45 
 
 		 610 aa  661    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  57.29 
 
 		 608 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 		 623 aa  694    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  53.07 
 
 		 607 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  52.41 
 
 		 602 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  68.03 
 
 		 610 aa  872    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  67.87 
 
 		 610 aa  870    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0417  GTP-binding protein  55.52 
 
 		 616 aa  643    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  61.99 
 
 		 596 aa  752    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  58.31 
 
 		 603 aa  703    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  58.31 
 
 		 603 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  57.36 
 
 		 602 aa  692    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  57.63 
 
 		 603 aa  693    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  57.19 
 
 		 608 aa  696    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  57.86 
 
 		 608 aa  710    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  54.82 
 
 		 605 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  58.46 
 
 		 613 aa  731    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0807  stress response membrane GTPase  55.83 
 
 		 611 aa  691    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0319085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  55.99 
 
 		 618 aa  710    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1342  stress response membrane GTPase  52.81 
 
 		 613 aa  673    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0910775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  59.84 
 
 		 615 aa  748    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 642 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  57.29 
 
 		 608 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  58.77 
 
 		 594 aa  709    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  56.11 
 
 		 611 aa  686    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  58.64 
 
 		 603 aa  702    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  57.05 
 
 		 602 aa  704    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  59.93 
 
 		 601 aa  740    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>