More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0748 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  47.9 
 
 		 736 aa  738    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  45.79 
 
 		 731 aa  650    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  45.79 
 
 		 727 aa  642    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  44.6 
 
 		 727 aa  643    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  48.3 
 
 		 736 aa  733    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  46.91 
 
 		 740 aa  694    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  45.01 
 
 		 727 aa  644    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  46.36 
 
 		 740 aa  686    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  46.09 
 
 		 740 aa  684    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  44.18 
 
 		 727 aa  637    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  44.69 
 
 		 730 aa  639    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  45.68 
 
 		 740 aa  685    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  46.09 
 
 		 740 aa  682    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  100 
 
 		 730 aa  1498    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  44.74 
 
 		 727 aa  642    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  45.67 
 
 		 734 aa  662    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  47.13 
 
 		 734 aa  711    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  45.13 
 
 		 730 aa  620  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  44.35 
 
 		 731 aa  620  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  46.48 
 
 		 730 aa  617  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  44.41 
 
 		 730 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  44.14 
 
 		 730 aa  595  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  41.39 
 
 		 729 aa  593  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  44.78 
 
 		 732 aa  585  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  39.92 
 
 		 728 aa  571  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  41.51 
 
 		 729 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  41.65 
 
 		 729 aa  562  1e-158  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  40.33 
 
 		 728 aa  559  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  34.42 
 
 		 828 aa  448  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  33.65 
 
 		 848 aa  421  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  33.33 
 
 		 826 aa  410  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  30.12 
 
 		 842 aa  359  8e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  30.03 
 
 		 691 aa  280  5e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  29.76 
 
 		 691 aa  279  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  29.76 
 
 		 691 aa  278  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  29.59 
 
 		 691 aa  277  5e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.37 
 
 		 703 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  29.88 
 
 		 692 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.87 
 
 		 706 aa  273  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  28.44 
 
 		 705 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  32.75 
 
 		 844 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  29.38 
 
 		 692 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  28.61 
 
 		 692 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  29.44 
 
 		 701 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  28.98 
 
 		 698 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  29.39 
 
 		 689 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  29.63 
 
 		 691 aa  270  8.999999999999999e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  29.95 
 
 		 700 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  28.19 
 
 		 704 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  29.17 
 
 		 704 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  29.17 
 
 		 704 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  29.17 
 
 		 704 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  29.17 
 
 		 704 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  29.1 
 
 		 700 aa  266  8e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  29.95 
 
 		 700 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  29.56 
 
 		 695 aa  266  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  29.17 
 
 		 802 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  29.17 
 
 		 801 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  29.95 
 
 		 700 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  29.95 
 
 		 700 aa  266  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  29.81 
 
 		 700 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  29.81 
 
 		 700 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  29.81 
 
 		 700 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  29.8 
 
 		 704 aa  265  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  29.81 
 
 		 700 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  29.81 
 
 		 700 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  29.81 
 
 		 700 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  29.81 
 
 		 700 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  29.81 
 
 		 700 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  29.67 
 
 		 700 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  29.67 
 
 		 700 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  29.81 
 
 		 700 aa  264  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  29.6 
 
 		 701 aa  264  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  28.28 
 
 		 701 aa  263  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  28.69 
 
 		 700 aa  263  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.07 
 
 		 700 aa  263  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  27.81 
 
 		 697 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  29.54 
 
 		 700 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  28.31 
 
 		 697 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  27.94 
 
 		 692 aa  262  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  28.78 
 
 		 692 aa  262  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0077  elongation factor G  29.48 
 
 		 691 aa  262  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  28.67 
 
 		 700 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  29.4 
 
 		 700 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  28.17 
 
 		 700 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  27.7 
 
 		 692 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0047  elongation factor G  29.3 
 
 		 700 aa  261  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029839  decreased coverage  6.96868e-24 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  29 
 
 		 700 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.23 
 
 		 697 aa  261  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  28.63 
 
 		 701 aa  261  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  28.53 
 
 		 704 aa  261  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  28.46 
 
 		 701 aa  260  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3446  elongation factor G  28.34 
 
 		 700 aa  259  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.607272  normal  0.483871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  28.57 
 
 		 704 aa  259  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  28.97 
 
 		 703 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  29.68 
 
 		 700 aa  259  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.63 
 
 		 697 aa  259  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  27.86 
 
 		 692 aa  258  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  28.27 
 
 		 704 aa  258  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  29.96 
 
 		 698 aa  257  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>