More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3686 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  44.6 
 
 		 740 aa  647    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  49.05 
 
 		 736 aa  716    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  69.45 
 
 		 730 aa  1031    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  58.22 
 
 		 729 aa  874    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  49.18 
 
 		 736 aa  708    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  58.49 
 
 		 729 aa  864    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  57.91 
 
 		 727 aa  853    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  57.36 
 
 		 727 aa  857    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  100 
 
 		 730 aa  1493    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  59.37 
 
 		 734 aa  877    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  67.31 
 
 		 732 aa  971    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  44.31 
 
 		 740 aa  659    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  68.67 
 
 		 731 aa  1031    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  58.16 
 
 		 728 aa  858    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  58.16 
 
 		 728 aa  877    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  68.95 
 
 		 731 aa  1044    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  57.77 
 
 		 727 aa  855    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  77.95 
 
 		 730 aa  1197    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  58.9 
 
 		 729 aa  869    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  45.13 
 
 		 730 aa  644    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  69.59 
 
 		 730 aa  1028    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  57.77 
 
 		 727 aa  855    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  69.92 
 
 		 730 aa  1042    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  57.83 
 
 		 727 aa  842    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  44.32 
 
 		 740 aa  642    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  47.95 
 
 		 734 aa  689    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  44.17 
 
 		 740 aa  645    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  43.78 
 
 		 740 aa  645    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  32.23 
 
 		 691 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  32.43 
 
 		 692 aa  302  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  31.76 
 
 		 696 aa  302  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  32.48 
 
 		 693 aa  301  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  32.12 
 
 		 692 aa  300  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  31.72 
 
 		 691 aa  300  9e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  31.72 
 
 		 691 aa  299  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  31.13 
 
 		 692 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  31.72 
 
 		 691 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  31 
 
 		 706 aa  298  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.86 
 
 		 700 aa  297  4e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  31.59 
 
 		 691 aa  296  7e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  31.73 
 
 		 691 aa  296  9e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  31.61 
 
 		 692 aa  296  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  30.79 
 
 		 691 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  30.79 
 
 		 691 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  32.27 
 
 		 695 aa  295  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  30.97 
 
 		 692 aa  294  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  31.77 
 
 		 701 aa  294  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  31.41 
 
 		 703 aa  294  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  32.21 
 
 		 700 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  30.45 
 
 		 692 aa  293  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  33.24 
 
 		 697 aa  293  6e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  31.66 
 
 		 692 aa  293  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.68 
 
 		 706 aa  293  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  32.07 
 
 		 700 aa  293  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  31.88 
 
 		 691 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  31.08 
 
 		 691 aa  292  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.94 
 
 		 703 aa  292  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  30.32 
 
 		 694 aa  292  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23880  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.57 
 
 		 715 aa  291  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0292811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  30.75 
 
 		 698 aa  291  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  31.98 
 
 		 695 aa  290  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  32.25 
 
 		 698 aa  290  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  30.8 
 
 		 697 aa  290  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  31.39 
 
 		 689 aa  290  9e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.36 
 
 		 700 aa  289  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  31.45 
 
 		 700 aa  289  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  30.29 
 
 		 692 aa  289  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  31.39 
 
 		 697 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.98 
 
 		 696 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  29.38 
 
 		 692 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  30.14 
 
 		 699 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  31.52 
 
 		 689 aa  288  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  31.59 
 
 		 699 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  31.28 
 
 		 700 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  31.67 
 
 		 698 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  31.72 
 
 		 692 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  31.17 
 
 		 698 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.65 
 
 		 704 aa  286  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  31.41 
 
 		 698 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3341  elongation factor G  31.56 
 
 		 699 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000527224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  32.02 
 
 		 697 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000062878  unclonable  0.0000000000098696 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  31.6 
 
 		 691 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  31.5 
 
 		 699 aa  284  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  31.01 
 
 		 700 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  31.01 
 
 		 700 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  31.41 
 
 		 699 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  31.41 
 
 		 699 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  31.01 
 
 		 700 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  31.01 
 
 		 700 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  31.01 
 
 		 700 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  31.01 
 
 		 700 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  31.01 
 
 		 700 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  31.01 
 
 		 700 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  31.01 
 
 		 700 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  30.56 
 
 		 704 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  31.07 
 
 		 705 aa  283  8.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  32.43 
 
 		 698 aa  283  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  33.59 
 
 		 844 aa  283  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  31.51 
 
 		 691 aa  282  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  31.59 
 
 		 691 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>