More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0613 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  65.66 
 
 
740 aa  1007    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  59.18 
 
 
736 aa  931    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  48 
 
 
727 aa  693    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  48 
 
 
727 aa  694    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  64.61 
 
 
740 aa  986    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  48.48 
 
 
727 aa  690    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  46.37 
 
 
730 aa  666    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  45.12 
 
 
729 aa  645    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  47.95 
 
 
730 aa  668    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  48.82 
 
 
734 aa  698    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  65.43 
 
 
740 aa  988    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  48.41 
 
 
727 aa  701    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  46.79 
 
 
731 aa  687    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  46.9 
 
 
727 aa  691    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  46.59 
 
 
730 aa  676    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  47.13 
 
 
730 aa  711    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  65.57 
 
 
740 aa  994    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  59.38 
 
 
736 aa  936    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  45.9 
 
 
732 aa  636    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  47.74 
 
 
731 aa  702    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  44.05 
 
 
728 aa  640    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  64.61 
 
 
740 aa  1003    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  47.14 
 
 
730 aa  679    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  48.08 
 
 
730 aa  687    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  100 
 
 
734 aa  1499    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  45.36 
 
 
729 aa  634  1e-180  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  43.64 
 
 
728 aa  622  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  44.26 
 
 
729 aa  612  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  35.02 
 
 
848 aa  483  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  35.22 
 
 
844 aa  479  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  35.31 
 
 
828 aa  472  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  34.74 
 
 
826 aa  459  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  34.49 
 
 
842 aa  458  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  30.95 
 
 
693 aa  281  3e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  30.3 
 
 
691 aa  280  8e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  28.98 
 
 
689 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  30.28 
 
 
704 aa  273  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  30.15 
 
 
689 aa  272  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  31.48 
 
 
691 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  28.44 
 
 
692 aa  271  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  30.12 
 
 
698 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  28.87 
 
 
705 aa  269  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  30.64 
 
 
701 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.16 
 
 
715 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  30.01 
 
 
698 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  30.05 
 
 
701 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  30.05 
 
 
701 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  30.05 
 
 
701 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  29.78 
 
 
700 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  30.2 
 
 
698 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  30.2 
 
 
698 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  30.2 
 
 
698 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  30.2 
 
 
698 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  30.32 
 
 
692 aa  266  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  30.71 
 
 
698 aa  266  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  29.33 
 
 
704 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  28.38 
 
 
703 aa  265  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  29.93 
 
 
698 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  30.23 
 
 
701 aa  264  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  29.84 
 
 
698 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  29.69 
 
 
691 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  28.99 
 
 
692 aa  263  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  29.41 
 
 
703 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  29.11 
 
 
688 aa  263  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  27.65 
 
 
700 aa  263  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  29.84 
 
 
698 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  29.84 
 
 
698 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  30 
 
 
692 aa  262  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  28.88 
 
 
698 aa  262  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  29.37 
 
 
694 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  28.51 
 
 
709 aa  262  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  29.65 
 
 
695 aa  262  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  29.29 
 
 
701 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  29.51 
 
 
701 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  29.54 
 
 
697 aa  261  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  30.5 
 
 
695 aa  261  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  29.84 
 
 
700 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  27.48 
 
 
702 aa  260  5.0000000000000005e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2784  elongation factor G  28.82 
 
 
696 aa  260  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621972  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.8 
 
 
704 aa  260  6e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  30.01 
 
 
698 aa  260  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  28.3 
 
 
692 aa  260  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  29.8 
 
 
698 aa  260  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  29.65 
 
 
701 aa  259  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  29.15 
 
 
688 aa  259  9e-68  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  28.69 
 
 
699 aa  259  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  30.41 
 
 
704 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  30.51 
 
 
802 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  28.3 
 
 
692 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  30.41 
 
 
704 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  30.51 
 
 
704 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  30.51 
 
 
801 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  27.79 
 
 
692 aa  259  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  29.12 
 
 
698 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  28.53 
 
 
699 aa  259  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  30.41 
 
 
704 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  27.42 
 
 
704 aa  259  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  29.8 
 
 
698 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  29.27 
 
 
705 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  30.29 
 
 
690 aa  259  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>