More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1957 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  55.74 
 
 		 736 aa  882    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  45.52 
 
 		 727 aa  661    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  45.1 
 
 		 727 aa  660    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  55.33 
 
 		 736 aa  877    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  43.78 
 
 		 730 aa  639    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  45.07 
 
 		 730 aa  648    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  95.14 
 
 		 740 aa  1435    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  43.99 
 
 		 731 aa  662    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  45.66 
 
 		 727 aa  665    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  43.78 
 
 		 731 aa  654    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  43.19 
 
 		 730 aa  635    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  95.68 
 
 		 740 aa  1465    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  45.62 
 
 		 734 aa  676    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  94.46 
 
 		 740 aa  1428    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  46.09 
 
 		 730 aa  687    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  45.28 
 
 		 730 aa  642    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  45.09 
 
 		 727 aa  654    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  45.1 
 
 		 727 aa  653    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  65.57 
 
 		 734 aa  1014    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  100 
 
 		 740 aa  1503    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  77.28 
 
 		 740 aa  1195    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  43.7 
 
 		 730 aa  633  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  42.45 
 
 		 732 aa  590  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  41.43 
 
 		 729 aa  592  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  39.92 
 
 		 729 aa  588  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  40.46 
 
 		 728 aa  588  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  40.6 
 
 		 728 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  40.74 
 
 		 729 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  33.65 
 
 		 842 aa  423  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  35.04 
 
 		 828 aa  423  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  33.02 
 
 		 844 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  38.36 
 
 		 848 aa  335  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  36.08 
 
 		 826 aa  299  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  27.16 
 
 		 700 aa  253  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.25 
 
 		 715 aa  253  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  27.47 
 
 		 704 aa  251  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  27.85 
 
 		 692 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  28.84 
 
 		 698 aa  249  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  27.87 
 
 		 703 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  27.72 
 
 		 691 aa  247  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  28.46 
 
 		 699 aa  247  6.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  27.04 
 
 		 701 aa  247  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.72 
 
 		 700 aa  246  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  28.05 
 
 		 705 aa  246  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  26.79 
 
 		 705 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  27.39 
 
 		 709 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  28.4 
 
 		 691 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0853  elongation factor G  26.77 
 
 		 707 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.367581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.39 
 
 		 703 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  26.78 
 
 		 704 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  29.48 
 
 		 699 aa  244  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  28.34 
 
 		 695 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  27.73 
 
 		 695 aa  244  5e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  27.76 
 
 		 691 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  27.76 
 
 		 691 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  26.85 
 
 		 698 aa  242  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  26.92 
 
 		 691 aa  242  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0687  translation elongation factor G  29.35 
 
 		 692 aa  241  4e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  25.83 
 
 		 704 aa  241  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  27.97 
 
 		 691 aa  241  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  28.19 
 
 		 695 aa  240  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  27.63 
 
 		 689 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  28.36 
 
 		 691 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  28.36 
 
 		 691 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  28.02 
 
 		 696 aa  239  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  27.2 
 
 		 699 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  27.86 
 
 		 691 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.24 
 
 		 704 aa  238  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  27.61 
 
 		 692 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  27.74 
 
 		 694 aa  237  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  25.83 
 
 		 713 aa  237  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  27.02 
 
 		 700 aa  236  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  27.26 
 
 		 691 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  28.21 
 
 		 697 aa  236  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  27.27 
 
 		 689 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  28.74 
 
 		 692 aa  236  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  27.33 
 
 		 695 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  30.43 
 
 		 985 aa  235  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  26.78 
 
 		 701 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  27.51 
 
 		 704 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  26.64 
 
 		 696 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  26.78 
 
 		 701 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  26.78 
 
 		 701 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  27.05 
 
 		 698 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  28.3 
 
 		 692 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  28.67 
 
 		 692 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  28.69 
 
 		 696 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  28.67 
 
 		 692 aa  233  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  28.67 
 
 		 692 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  28.67 
 
 		 692 aa  233  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  28.67 
 
 		 692 aa  233  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  28.67 
 
 		 692 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  27.1 
 
 		 688 aa  232  2e-59  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  26.66 
 
 		 693 aa  232  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl622  elongation factor G  27.82 
 
 		 689 aa  232  2e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  29.87 
 
 		 994 aa  232  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  25.72 
 
 		 978 aa  232  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  26.96 
 
 		 703 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  28.38 
 
 		 697 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  28.67 
 
 		 692 aa  232  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>