More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0938 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  56.95 
 
 		 736 aa  908    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  45.47 
 
 		 727 aa  651    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  76.69 
 
 		 740 aa  1183    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  45.6 
 
 		 727 aa  659    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  76.29 
 
 		 740 aa  1190    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  46.91 
 
 		 730 aa  694    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  43.52 
 
 		 731 aa  641    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  100 
 
 		 740 aa  1502    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  46.47 
 
 		 734 aa  668    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  45.73 
 
 		 727 aa  659    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  57.08 
 
 		 736 aa  894    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  45.22 
 
 		 731 aa  667    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  45.72 
 
 		 727 aa  644    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  45.49 
 
 		 730 aa  639    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  45.88 
 
 		 727 aa  660    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  77.28 
 
 		 740 aa  1178    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  65.66 
 
 		 734 aa  1007    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  75.92 
 
 		 740 aa  1164    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  44.14 
 
 		 730 aa  632  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  44.6 
 
 		 730 aa  625  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  44.07 
 
 		 730 aa  623  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  45.21 
 
 		 730 aa  625  1e-177  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  43.37 
 
 		 729 aa  620  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  43.79 
 
 		 732 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  42.76 
 
 		 728 aa  607  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  43.09 
 
 		 729 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  43.31 
 
 		 728 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  43.37 
 
 		 729 aa  596  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  34.24 
 
 		 844 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  33.74 
 
 		 826 aa  427  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  33.49 
 
 		 828 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  37.79 
 
 		 848 aa  336  7.999999999999999e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  35.73 
 
 		 842 aa  309  1.0000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  28.81 
 
 		 994 aa  281  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  28.08 
 
 		 978 aa  260  5.0000000000000005e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  28.76 
 
 		 701 aa  257  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  29.03 
 
 		 698 aa  253  8.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  30.24 
 
 		 701 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  30.12 
 
 		 696 aa  252  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  30.34 
 
 		 701 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  27.93 
 
 		 708 aa  250  8e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  27.87 
 
 		 709 aa  249  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  29.48 
 
 		 699 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  34.29 
 
 		 985 aa  249  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  27.93 
 
 		 708 aa  249  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  29.21 
 
 		 695 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.42 
 
 		 706 aa  248  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  29.08 
 
 		 699 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  28.67 
 
 		 700 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  28.82 
 
 		 697 aa  244  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  29.4 
 
 		 698 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  29.4 
 
 		 698 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  28.16 
 
 		 703 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  29.4 
 
 		 698 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  29.4 
 
 		 698 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  28.8 
 
 		 698 aa  243  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.84 
 
 		 700 aa  241  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  28.38 
 
 		 698 aa  241  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  29.13 
 
 		 698 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  29.04 
 
 		 699 aa  240  8e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  27.32 
 
 		 693 aa  240  9e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  28.11 
 
 		 688 aa  239  9e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  28.55 
 
 		 691 aa  239  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  32.02 
 
 		 974 aa  239  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  28.9 
 
 		 698 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  28.57 
 
 		 698 aa  239  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  28.46 
 
 		 694 aa  238  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.86 
 
 		 700 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0861  elongation factor G  29.27 
 
 		 698 aa  238  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  28.46 
 
 		 694 aa  238  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  29.32 
 
 		 698 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  29.32 
 
 		 698 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4320  elongation factor G  28.21 
 
 		 698 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000582121  unclonable  0.000000000247136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  27.79 
 
 		 704 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  26.85 
 
 		 703 aa  236  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  28.17 
 
 		 700 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  27.89 
 
 		 700 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  27.94 
 
 		 689 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  28.59 
 
 		 695 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  27.33 
 
 		 692 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  29.01 
 
 		 692 aa  233  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  28.96 
 
 		 699 aa  232  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  27.88 
 
 		 696 aa  232  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  29.28 
 
 		 700 aa  232  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  29.72 
 
 		 692 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  27.61 
 
 		 706 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23880  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.64 
 
 		 715 aa  231  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0292811  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  27.6 
 
 		 703 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  27.05 
 
 		 693 aa  231  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  27.31 
 
 		 689 aa  231  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  28.38 
 
 		 691 aa  231  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  27.05 
 
 		 693 aa  231  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0834  elongation factor G  28.42 
 
 		 706 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.757744  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  28.78 
 
 		 699 aa  231  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  28.32 
 
 		 706 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  27.45 
 
 		 713 aa  231  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0687  translation elongation factor G  28.73 
 
 		 692 aa  231  5e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  28.1 
 
 		 689 aa  230  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  28.49 
 
 		 696 aa  230  8e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  26.44 
 
 		 692 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>