More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0614 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  46.99 
 
 
736 aa  676    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  47.81 
 
 
736 aa  689    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  100 
 
 
727 aa  1494    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  45.53 
 
 
740 aa  663    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  44.6 
 
 
730 aa  643    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  45.88 
 
 
740 aa  660    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  98.76 
 
 
727 aa  1479    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  53.01 
 
 
729 aa  767    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  53.09 
 
 
728 aa  766    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  57.77 
 
 
730 aa  833    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  59.2 
 
 
730 aa  847    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  57.42 
 
 
730 aa  817    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  53.22 
 
 
729 aa  766    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  57.89 
 
 
731 aa  834    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  56.66 
 
 
732 aa  789    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  97.25 
 
 
727 aa  1462    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  57.71 
 
 
730 aa  846    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  54.32 
 
 
729 aa  765    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  92.71 
 
 
727 aa  1414    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  45.1 
 
 
740 aa  648    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  81.43 
 
 
727 aa  1259    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  45.66 
 
 
740 aa  652    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  45.66 
 
 
740 aa  650    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  53.36 
 
 
728 aa  754    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  57.01 
 
 
731 aa  831    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  59.2 
 
 
734 aa  883    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  58.87 
 
 
730 aa  842    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  48.41 
 
 
734 aa  701    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  31.82 
 
 
706 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0306  translation elongation factor G  30.73 
 
 
715 aa  315  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00107497  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  31.42 
 
 
696 aa  313  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  31.04 
 
 
709 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  32.03 
 
 
691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  31.87 
 
 
697 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  30.35 
 
 
708 aa  307  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  32.71 
 
 
697 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  31.63 
 
 
691 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  29.96 
 
 
708 aa  301  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  31.22 
 
 
691 aa  301  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  30.04 
 
 
704 aa  301  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  31.31 
 
 
692 aa  301  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  29.91 
 
 
704 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  29.91 
 
 
704 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  29.91 
 
 
704 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  31.47 
 
 
698 aa  300  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  31.17 
 
 
700 aa  300  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  30.29 
 
 
701 aa  300  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  29.91 
 
 
802 aa  300  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  30.72 
 
 
692 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  30.27 
 
 
698 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  30.97 
 
 
698 aa  299  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  29.91 
 
 
801 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  31.61 
 
 
703 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  30.76 
 
 
700 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  30.76 
 
 
700 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  30.76 
 
 
700 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  30.76 
 
 
700 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  31.03 
 
 
700 aa  299  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  30.76 
 
 
700 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  30.76 
 
 
700 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  30.76 
 
 
700 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  30.76 
 
 
700 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  30.52 
 
 
696 aa  298  3e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  30.95 
 
 
692 aa  298  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  31.49 
 
 
692 aa  297  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  30.89 
 
 
700 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0275  elongation factor G  30.85 
 
 
702 aa  296  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.374019  hitchhiker  0.000000209293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  31.38 
 
 
692 aa  296  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.65 
 
 
706 aa  296  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  32.12 
 
 
698 aa  296  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2953  elongation factor G  31.5 
 
 
708 aa  296  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00010566  hitchhiker  0.00000914286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  30.96 
 
 
691 aa  296  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  31.17 
 
 
698 aa  296  9e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  29.8 
 
 
701 aa  296  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  30.74 
 
 
700 aa  296  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  31.51 
 
 
691 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  30.76 
 
 
700 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  31.57 
 
 
723 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  30.74 
 
 
700 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  31.71 
 
 
700 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  30.47 
 
 
700 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  31.51 
 
 
691 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  30.35 
 
 
703 aa  295  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  29.93 
 
 
701 aa  294  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  30.55 
 
 
699 aa  294  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  30.37 
 
 
706 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  30.74 
 
 
700 aa  294  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0834  elongation factor G  30.37 
 
 
706 aa  294  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.757744  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  30.57 
 
 
689 aa  293  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  30.49 
 
 
698 aa  294  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  29.78 
 
 
699 aa  293  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  31.41 
 
 
698 aa  293  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  30.87 
 
 
698 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  30.87 
 
 
698 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.84 
 
 
697 aa  293  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  30.87 
 
 
698 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  30.87 
 
 
698 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  30.98 
 
 
697 aa  293  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.72 
 
 
691 aa  293  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  30.46 
 
 
689 aa  292  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>