More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1785 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  55.6 
 
 
740 aa  884    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  50.21 
 
 
734 aa  713    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  100 
 
 
736 aa  1495    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  54.92 
 
 
740 aa  861    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  46.05 
 
 
728 aa  664    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  48.29 
 
 
731 aa  704    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  47.9 
 
 
730 aa  738    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  56.95 
 
 
740 aa  908    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  49.05 
 
 
730 aa  695    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  55.74 
 
 
740 aa  870    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  47.47 
 
 
727 aa  689    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  47.81 
 
 
727 aa  689    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  84.78 
 
 
736 aa  1326    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  46.59 
 
 
728 aa  654    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  47.4 
 
 
727 aa  681    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  47.41 
 
 
731 aa  683    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  47.97 
 
 
730 aa  698    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  48.62 
 
 
727 aa  696    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  47.26 
 
 
727 aa  683    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  46.12 
 
 
729 aa  652    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  46.39 
 
 
729 aa  644    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  46.26 
 
 
729 aa  667    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  48.7 
 
 
730 aa  691    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  49.25 
 
 
730 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  47.89 
 
 
730 aa  672    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  59.18 
 
 
734 aa  931    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  55.74 
 
 
740 aa  866    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  45.8 
 
 
732 aa  634  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  34.81 
 
 
828 aa  470  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  33.33 
 
 
848 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  34.69 
 
 
844 aa  312  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  33.59 
 
 
842 aa  295  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  30.4 
 
 
701 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  31.45 
 
 
695 aa  286  9e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  29.93 
 
 
702 aa  284  4.0000000000000003e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  33.33 
 
 
826 aa  281  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  30.25 
 
 
699 aa  280  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  29.96 
 
 
698 aa  277  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  27.42 
 
 
700 aa  276  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  29.97 
 
 
698 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  28.8 
 
 
691 aa  276  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  30 
 
 
698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  29.6 
 
 
699 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  29.7 
 
 
698 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  29.34 
 
 
698 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  29.34 
 
 
698 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.97 
 
 
706 aa  273  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  28.87 
 
 
704 aa  273  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  28.63 
 
 
697 aa  273  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000062878  unclonable  0.0000000000098696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  29.63 
 
 
698 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  29.63 
 
 
698 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  29.63 
 
 
698 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  29.63 
 
 
698 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  30.05 
 
 
692 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  30.22 
 
 
698 aa  273  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  28.95 
 
 
705 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  29.57 
 
 
698 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  29.3 
 
 
697 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  29.04 
 
 
698 aa  272  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  29.22 
 
 
691 aa  271  4e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  28.46 
 
 
701 aa  271  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  29.3 
 
 
692 aa  271  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  28.33 
 
 
701 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  29.05 
 
 
698 aa  270  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  28.86 
 
 
701 aa  270  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  29.32 
 
 
688 aa  270  7e-71  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.46 
 
 
703 aa  270  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4918  translation elongation factor G  29.28 
 
 
699 aa  269  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  27.72 
 
 
691 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  29.21 
 
 
692 aa  267  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  28.3 
 
 
698 aa  267  5.999999999999999e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  28.49 
 
 
692 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  28.22 
 
 
701 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  29.72 
 
 
698 aa  266  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0455  elongation factor G  28.88 
 
 
699 aa  266  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  27.08 
 
 
704 aa  266  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  29.16 
 
 
691 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  29.01 
 
 
697 aa  266  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  28.55 
 
 
692 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4320  elongation factor G  29.63 
 
 
698 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000582121  unclonable  0.000000000247136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  28.59 
 
 
706 aa  265  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  28.42 
 
 
723 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  28.67 
 
 
700 aa  265  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  28 
 
 
699 aa  265  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  27.62 
 
 
705 aa  265  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  29.05 
 
 
698 aa  264  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  27.98 
 
 
699 aa  264  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.72 
 
 
702 aa  264  4.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  29.06 
 
 
704 aa  263  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0548  translation elongation factor G  28.7 
 
 
695 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0770  elongation factor G  28.89 
 
 
695 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  28.61 
 
 
692 aa  263  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  28.3 
 
 
700 aa  263  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  28.74 
 
 
692 aa  263  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  28.67 
 
 
692 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  28.67 
 
 
692 aa  262  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  28.67 
 
 
692 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  28.67 
 
 
692 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0796  elongation factor G  28.89 
 
 
695 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0475216  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  27.98 
 
 
703 aa  262  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>