More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00330 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA00330  translation elongation factor 2, putative  100 
 
 		 1115 aa  2284    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36549  Translation elongation factor 2/ribosome biogenesis protein RIA1 and related proteins  41.97 
 
 		 1035 aa  796    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  decreased coverage  0.00970244 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_438  predicted protein  35.39 
 
 		 1001 aa  307  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  34.82 
 
 		 826 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  34.51 
 
 		 848 aa  246  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  34.04 
 
 		 842 aa  244  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  33.49 
 
 		 828 aa  239  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  33.02 
 
 		 844 aa  233  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20188  predicted protein  37.85 
 
 		 693 aa  195  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248743  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  30.4 
 
 		 974 aa  182  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  31.33 
 
 		 985 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  31.08 
 
 		 994 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  37.39 
 
 		 736 aa  159  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  45.29 
 
 		 731 aa  155  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  36.55 
 
 		 736 aa  153  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  45.25 
 
 		 730 aa  152  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  44.32 
 
 		 728 aa  152  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  44.86 
 
 		 728 aa  152  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  46.11 
 
 		 731 aa  151  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  45.86 
 
 		 729 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  46.11 
 
 		 729 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  45.16 
 
 		 729 aa  147  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45319  predicted protein  28.64 
 
 		 1013 aa  143  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678444  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  40.86 
 
 		 734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  43.6 
 
 		 727 aa  142  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  39.34 
 
 		 730 aa  141  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  40.64 
 
 		 734 aa  141  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  42.7 
 
 		 727 aa  140  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  44.31 
 
 		 727 aa  140  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  44.31 
 
 		 727 aa  140  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  44.31 
 
 		 727 aa  140  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  41.95 
 
 		 740 aa  138  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  40.98 
 
 		 740 aa  138  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  41.95 
 
 		 740 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  41.95 
 
 		 740 aa  137  9e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  43.17 
 
 		 730 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  41.95 
 
 		 740 aa  137  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  42.19 
 
 		 730 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  35.83 
 
 		 732 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  45.51 
 
 		 730 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  43.36 
 
 		 608 aa  124  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  28.75 
 
 		 978 aa  124  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  40 
 
 		 599 aa  121  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  44.06 
 
 		 603 aa  120  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  40.97 
 
 		 602 aa  119  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7374  GTP-binding protein LepA  40.91 
 
 		 617 aa  119  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  41.62 
 
 		 730 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  40.97 
 
 		 602 aa  119  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  41.96 
 
 		 608 aa  118  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3360  GTP-binding protein TypA  37.14 
 
 		 607 aa  118  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  41.55 
 
 		 616 aa  118  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  43.36 
 
 		 604 aa  118  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  40.97 
 
 		 602 aa  118  7.999999999999999e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  36.11 
 
 		 604 aa  117  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  40.28 
 
 		 602 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3168  GTP-binding protein LepA  39.64 
 
 		 600 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.998124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0438  GTP-binding protein LepA  44.14 
 
 		 610 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.587658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  42.66 
 
 		 603 aa  117  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0343  GTP-binding protein LepA  43.45 
 
 		 603 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.697436  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  40.56 
 
 		 610 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  41.67 
 
 		 603 aa  117  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  40.97 
 
 		 608 aa  116  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4033  GTP-binding protein LepA  44.06 
 
 		 595 aa  116  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0111915  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  40.56 
 
 		 614 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  39.58 
 
 		 599 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  41.26 
 
 		 592 aa  115  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  39.47 
 
 		 610 aa  115  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  39.16 
 
 		 615 aa  115  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1677  GTP-binding protein LepA  43.33 
 
 		 605 aa  115  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  39.16 
 
 		 605 aa  115  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2197  GTP-binding protein LepA  43.97 
 
 		 601 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0373  GTP-binding protein LepA  42.38 
 
 		 644 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.598212 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  39.86 
 
 		 612 aa  114  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_002950  PG1241  GTP-binding protein LepA  40.56 
 
 		 595 aa  114  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1454  GTP-binding protein LepA  41.96 
 
 		 596 aa  114  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0893898  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04181  GTP-binding protein LepA  42.07 
 
 		 602 aa  114  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.570977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0355  GTP-binding protein LepA  40.83 
 
 		 603 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2216  GTP-binding protein LepA  41.01 
 
 		 630 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  42.66 
 
 		 611 aa  114  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  41.26 
 
 		 608 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0469  GTP-binding protein LepA  41.45 
 
 		 644 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.942925  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  40.85 
 
 		 623 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  34.91 
 
 		 602 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  39.58 
 
 		 603 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  39.58 
 
 		 603 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  39.58 
 
 		 603 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  40.28 
 
 		 604 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1118  GTP-binding protein LepA  39.86 
 
 		 596 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  40.56 
 
 		 608 aa  114  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0312  GTP-binding protein TypA  39.58 
 
 		 603 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  39.58 
 
 		 603 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  38.92 
 
 		 608 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2334  GTP-binding protein LepA  40 
 
 		 601 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.871184  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  39.58 
 
 		 609 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2246  GTP-binding protein LepA  40 
 
 		 601 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  40 
 
 		 601 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  38.19 
 
 		 602 aa  113  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  39.58 
 
 		 603 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0929  GTP-binding protein LepA  41.26 
 
 		 595 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0259799 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  39.58 
 
 		 609 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>