More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66828 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  77.25 
 
 		 844 aa  1372    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  61.12 
 
 		 828 aa  1056    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  76.02 
 
 		 826 aa  1317    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  62.82 
 
 		 848 aa  1089    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  100 
 
 		 842 aa  1738    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  36.64 
 
 		 974 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  37.65 
 
 		 994 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  36.06 
 
 		 985 aa  555  1e-156  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45319  predicted protein  33.64 
 
 		 1013 aa  511  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678444  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  34.49 
 
 		 734 aa  458  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  33.45 
 
 		 731 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  30.71 
 
 		 978 aa  415  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_438  predicted protein  32.81 
 
 		 1001 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  33.65 
 
 		 740 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  32.5 
 
 		 730 aa  395  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  32.3 
 
 		 730 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  32.02 
 
 		 729 aa  386  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  30.12 
 
 		 730 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  31.78 
 
 		 732 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  30.32 
 
 		 727 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  30.2 
 
 		 727 aa  356  1e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  30.82 
 
 		 730 aa  351  3e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  35.73 
 
 		 740 aa  309  2.0000000000000002e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  33.91 
 
 		 736 aa  305  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  35.69 
 
 		 740 aa  298  2e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  35.74 
 
 		 730 aa  297  6e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  33.59 
 
 		 736 aa  295  3e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  35.43 
 
 		 740 aa  293  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  34.67 
 
 		 734 aa  292  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  35.49 
 
 		 740 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  32.68 
 
 		 730 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  30.39 
 
 		 731 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  30.59 
 
 		 727 aa  251  5e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  31.65 
 
 		 729 aa  251  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  30.92 
 
 		 727 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  31.26 
 
 		 727 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  31.02 
 
 		 729 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00330  translation elongation factor 2, putative  36.41 
 
 		 1115 aa  242  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  30.66 
 
 		 728 aa  242  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36549  Translation elongation factor 2/ribosome biogenesis protein RIA1 and related proteins  35.4 
 
 		 1035 aa  240  8e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  decreased coverage  0.00970244 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  30.12 
 
 		 728 aa  232  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  27.02 
 
 		 706 aa  204  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  25.77 
 
 		 695 aa  197  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  26.41 
 
 		 697 aa  197  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  26.7 
 
 		 704 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  25.89 
 
 		 701 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  25.89 
 
 		 701 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  25.89 
 
 		 701 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  25.49 
 
 		 700 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  24.78 
 
 		 705 aa  193  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  25.58 
 
 		 699 aa  191  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  25.58 
 
 		 699 aa  191  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  27.08 
 
 		 705 aa  190  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  25.51 
 
 		 700 aa  188  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  24.91 
 
 		 689 aa  187  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  25.06 
 
 		 700 aa  187  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  26.8 
 
 		 698 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  26.71 
 
 		 700 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  25.15 
 
 		 701 aa  185  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  24.48 
 
 		 692 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  26.35 
 
 		 698 aa  184  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  24.16 
 
 		 699 aa  184  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  25.3 
 
 		 692 aa  183  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  25.56 
 
 		 696 aa  183  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  24.88 
 
 		 702 aa  183  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  25.3 
 
 		 692 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  25.3 
 
 		 692 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  25.3 
 
 		 692 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  25.3 
 
 		 692 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  25.3 
 
 		 692 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  24.01 
 
 		 692 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  25.18 
 
 		 692 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  25.33 
 
 		 692 aa  181  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  25 
 
 		 692 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  26.48 
 
 		 698 aa  181  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  25.3 
 
 		 692 aa  180  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  26.45 
 
 		 694 aa  180  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  25.25 
 
 		 699 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  26.32 
 
 		 694 aa  180  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  25.79 
 
 		 694 aa  180  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  25.18 
 
 		 693 aa  179  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0834  elongation factor G  25.21 
 
 		 706 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.757744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  25.12 
 
 		 692 aa  178  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  26.28 
 
 		 700 aa  177  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  24.35 
 
 		 691 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  27.08 
 
 		 704 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  24.35 
 
 		 691 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  25.15 
 
 		 706 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.37 
 
 		 703 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03950  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.8 
 
 		 698 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  24.5 
 
 		 688 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  26.08 
 
 		 700 aa  175  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0623  translation elongation factor G  24.7 
 
 		 701 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  23.83 
 
 		 693 aa  174  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  23.26 
 
 		 692 aa  173  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  25.22 
 
 		 698 aa  173  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  24.94 
 
 		 692 aa  172  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4551  elongation factor G  24.82 
 
 		 701 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_002950  PG1940  elongation factor G  26.06 
 
 		 707 aa  171  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  26.37 
 
 		 692 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>