More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND06220 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  73.8 
 
 		 844 aa  1286    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  100 
 
 		 826 aa  1712    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  62.8 
 
 		 848 aa  1075    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  76.02 
 
 		 842 aa  1317    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  62 
 
 		 828 aa  1064    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  38.01 
 
 		 994 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  36.97 
 
 		 974 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  36.08 
 
 		 985 aa  542  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45319  predicted protein  33.91 
 
 		 1013 aa  496  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678444  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  34.74 
 
 		 734 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  33.49 
 
 		 736 aa  431  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  33.74 
 
 		 740 aa  427  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  33.98 
 
 		 740 aa  410  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  33.33 
 
 		 730 aa  410  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  34.63 
 
 		 740 aa  412  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  34.06 
 
 		 730 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_438  predicted protein  32.36 
 
 		 1001 aa  405  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  30.45 
 
 		 978 aa  397  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  32.32 
 
 		 729 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  36.27 
 
 		 740 aa  296  7e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  36.44 
 
 		 730 aa  294  5e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  36.08 
 
 		 740 aa  290  1e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  33.33 
 
 		 736 aa  281  5e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  33.72 
 
 		 730 aa  266  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  33.46 
 
 		 731 aa  262  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  33.71 
 
 		 734 aa  260  6e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  32.56 
 
 		 730 aa  255  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  33.08 
 
 		 731 aa  254  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  33.46 
 
 		 732 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  32.21 
 
 		 730 aa  250  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00330  translation elongation factor 2, putative  34.82 
 
 		 1115 aa  248  3e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  31.7 
 
 		 727 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36549  Translation elongation factor 2/ribosome biogenesis protein RIA1 and related proteins  36.97 
 
 		 1035 aa  243  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  decreased coverage  0.00970244 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  31.97 
 
 		 727 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  31.1 
 
 		 727 aa  242  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  32.49 
 
 		 727 aa  241  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  31.38 
 
 		 728 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  31.77 
 
 		 727 aa  238  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  30.89 
 
 		 729 aa  237  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  30.12 
 
 		 729 aa  234  5e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  30.89 
 
 		 728 aa  231  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20188  predicted protein  28.21 
 
 		 693 aa  201  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  27.43 
 
 		 701 aa  198  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  27.32 
 
 		 695 aa  194  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  26.82 
 
 		 700 aa  185  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  26.36 
 
 		 693 aa  183  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.58 
 
 		 703 aa  183  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  26.31 
 
 		 692 aa  181  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  25.98 
 
 		 692 aa  180  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  25.73 
 
 		 692 aa  179  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  25.98 
 
 		 692 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  26.34 
 
 		 701 aa  179  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  25.57 
 
 		 699 aa  178  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  26.22 
 
 		 695 aa  178  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  25.98 
 
 		 692 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  26.92 
 
 		 689 aa  177  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  25.85 
 
 		 692 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  25.98 
 
 		 692 aa  177  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  25.98 
 
 		 692 aa  177  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  25.98 
 
 		 692 aa  177  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  25.25 
 
 		 699 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  25.85 
 
 		 692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  26.56 
 
 		 706 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  25.25 
 
 		 699 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  25.67 
 
 		 692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  25.8 
 
 		 698 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0494  translation elongation factor G  25.74 
 
 		 705 aa  174  5e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0834  elongation factor G  26.43 
 
 		 706 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.757744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  24.91 
 
 		 689 aa  173  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  25.5 
 
 		 700 aa  173  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  25.46 
 
 		 692 aa  173  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  26.74 
 
 		 698 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  27.2 
 
 		 704 aa  172  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  26.93 
 
 		 698 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  25.87 
 
 		 706 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  26.53 
 
 		 698 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  26.53 
 
 		 698 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  27.06 
 
 		 704 aa  171  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  25.68 
 
 		 704 aa  171  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  25.68 
 
 		 696 aa  171  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  25.09 
 
 		 693 aa  170  8e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0306  translation elongation factor G  25 
 
 		 715 aa  170  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00107497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1753  elongation factor G  25.6 
 
 		 703 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.751097  normal  0.0412886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0796  elongation factor G  27.04 
 
 		 695 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0475216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0770  elongation factor G  27.04 
 
 		 695 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3303  elongation factor G  25.62 
 
 		 695 aa  169  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0253676 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.71 
 
 		 691 aa  169  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  25.91 
 
 		 698 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  25.6 
 
 		 703 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  25.47 
 
 		 698 aa  168  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  24.75 
 
 		 694 aa  168  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  26.32 
 
 		 698 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  26.28 
 
 		 698 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  23.87 
 
 		 692 aa  167  8e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  24.63 
 
 		 702 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  25 
 
 		 673 aa  166  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0125  elongation factor G  24.79 
 
 		 709 aa  165  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  25.5 
 
 		 703 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0285  elongation factor G  26.6 
 
 		 683 aa  165  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  25.25 
 
 		 730 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>