More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36041 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  41.32 
 
 		 985 aa  743    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  39.94 
 
 		 994 aa  654    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  100 
 
 		 978 aa  1998    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  37.89 
 
 		 974 aa  664    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45319  predicted protein  34.44 
 
 		 1013 aa  599  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678444  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  29.87 
 
 		 828 aa  425  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  31.7 
 
 		 844 aa  416  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  30.71 
 
 		 842 aa  415  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  30.45 
 
 		 826 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  30.32 
 
 		 848 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  28.08 
 
 		 740 aa  260  7e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_438  predicted protein  24.29 
 
 		 1001 aa  238  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  27.17 
 
 		 731 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  25.33 
 
 		 740 aa  226  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  26.73 
 
 		 730 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  25.42 
 
 		 740 aa  221  6e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  25.72 
 
 		 740 aa  220  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  25.03 
 
 		 729 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  25.75 
 
 		 734 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  25.03 
 
 		 727 aa  205  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  24.66 
 
 		 727 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  25.24 
 
 		 727 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  24.67 
 
 		 727 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  24.66 
 
 		 727 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  28.88 
 
 		 740 aa  164  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  28.88 
 
 		 734 aa  161  6e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  27.95 
 
 		 730 aa  157  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  27.53 
 
 		 736 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  27.84 
 
 		 736 aa  152  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  26.85 
 
 		 730 aa  151  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  26.74 
 
 		 731 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  26.42 
 
 		 730 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  27.74 
 
 		 730 aa  140  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  27.29 
 
 		 730 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  27.09 
 
 		 728 aa  137  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  27.97 
 
 		 728 aa  137  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20188  predicted protein  24.19 
 
 		 693 aa  135  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248743  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36549  Translation elongation factor 2/ribosome biogenesis protein RIA1 and related proteins  25.99 
 
 		 1035 aa  130  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  decreased coverage  0.00970244 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  26.87 
 
 		 732 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  25.73 
 
 		 729 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  27.46 
 
 		 729 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00330  translation elongation factor 2, putative  28.57 
 
 		 1115 aa  120  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2371  GTP-binding protein LepA  35.92 
 
 		 604 aa  97.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1268  GTP-binding protein TypA  31.55 
 
 		 629 aa  96.3  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0660  GTP-binding protein LepA  34.34 
 
 		 599 aa  95.5  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00722233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1179  GTP-binding protein LepA  34.29 
 
 		 599 aa  95.1  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000382196  hitchhiker  0.00186525 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  36.3 
 
 		 613 aa  94  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  37.33 
 
 		 613 aa  93.2  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06110  GTP-Binding protein lepA, putative  31.91 
 
 		 693 aa  92.8  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0166932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  34.48 
 
 		 630 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0603  GTP-binding protein TypA  36.3 
 
 		 619 aa  92.4  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.212594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  33.15 
 
 		 605 aa  92  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  34.48 
 
 		 601 aa  91.3  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  30 
 
 		 613 aa  91.3  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2334  GTP-binding protein LepA  34.48 
 
 		 601 aa  91.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.871184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2246  GTP-binding protein LepA  34.48 
 
 		 601 aa  91.3  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1761  small GTP-binding protein  38.85 
 
 		 634 aa  91.3  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  33.71 
 
 		 620 aa  90.9  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0440  GTP-binding protein LepA  35.62 
 
 		 603 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239909  normal  0.261131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  34.29 
 
 		 541 aa  90.9  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  31.25 
 
 		 630 aa  90.5  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  34.9 
 
 		 624 aa  90.9  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2944  peptide chain release factor 3  34.29 
 
 		 539 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0217278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2337  peptide chain release factor 3  34.67 
 
 		 541 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.707548  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1210  GTP-binding protein LepA  34.46 
 
 		 607 aa  89.7  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3360  GTP-binding protein TypA  37.76 
 
 		 607 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  36.99 
 
 		 615 aa  89.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  33.55 
 
 		 622 aa  89.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  35.62 
 
 		 615 aa  89.4  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  34.29 
 
 		 541 aa  89  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  33.96 
 
 		 631 aa  89  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23444  predicted protein  36.36 
 
 		 676 aa  88.6  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.28731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  33.57 
 
 		 539 aa  88.6  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  27.03 
 
 		 641 aa  88.6  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1509  GTP-binding protein LepA  34.75 
 
 		 606 aa  88.2  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.783077  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2027  peptide chain release factor 3  32.7 
 
 		 539 aa  88.2  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1680  peptide chain release factor 3  34.29 
 
 		 539 aa  88.2  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0890826  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0148  GTP-binding protein LepA  35.37 
 
 		 608 aa  88.2  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  35.46 
 
 		 603 aa  88.2  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  34.25 
 
 		 636 aa  87.8  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  30.77 
 
 		 650 aa  88.2  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1111  GTP-binding protein LepA  34.93 
 
 		 603 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  36.88 
 
 		 615 aa  87.8  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  34.93 
 
 		 608 aa  87.8  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  35.53 
 
 		 620 aa  87.8  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3444  GTP-binding protein LepA  34.93 
 
 		 603 aa  87.8  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  34.75 
 
 		 642 aa  87.8  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  36.88 
 
 		 615 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  36.69 
 
 		 614 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  36.69 
 
 		 614 aa  87  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  36.88 
 
 		 615 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1009  GTP-binding protein LepA  35.71 
 
 		 609 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0469  GTP-binding protein LepA  35.71 
 
 		 644 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.942925  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0591  GTP-binding protein LepA  36.73 
 
 		 637 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4269  GTP-binding protein TypA  32.87 
 
 		 633 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  35.46 
 
 		 603 aa  87.4  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43212  predicted protein  36.36 
 
 		 602 aa  87  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0723901  normal  0.0385264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2197  GTP-binding protein LepA  33.1 
 
 		 601 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332949 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4115  GTP-binding protein TypA  32.87 
 
 		 633 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1278  GTP-binding protein LepA  35.62 
 
 		 601 aa  87  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0142175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>