More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43212 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  55.1 
 
 
606 aa  657    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2717  GTP-binding protein TypA  58.33 
 
 
613 aa  690    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  54.51 
 
 
608 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  54.02 
 
 
610 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  56.86 
 
 
627 aa  691    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  57.26 
 
 
613 aa  692    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23444  predicted protein  54.4 
 
 
676 aa  662    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.28731  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43212  predicted protein  100 
 
 
602 aa  1231    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0723901  normal  0.0385264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.23 
 
 
614 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  57.14 
 
 
607 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  52.32 
 
 
632 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.66 
 
 
605 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 
592 aa  634  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  51.64 
 
 
616 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 
603 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 
603 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  52.68 
 
 
605 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  52.51 
 
 
604 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 
603 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  53.23 
 
 
603 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 
609 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  51.6 
 
 
614 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  51.36 
 
 
608 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 
603 aa  621  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  51.89 
 
 
612 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 
607 aa  621  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 
614 aa  621  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  52.8 
 
 
598 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  51.92 
 
 
607 aa  615  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 
615 aa  616  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  50.75 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  50.75 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 
614 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  52.02 
 
 
599 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
603 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 
606 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  52.04 
 
 
610 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  51.87 
 
 
610 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 
609 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  51.44 
 
 
615 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  51.44 
 
 
615 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  52.89 
 
 
603 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  52.14 
 
 
602 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  52.61 
 
 
609 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  51.51 
 
 
598 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0312  GTP-binding protein TypA  52.89 
 
 
603 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 
613 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  51.78 
 
 
600 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 
603 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 
614 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  51.59 
 
 
598 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  51.51 
 
 
598 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  52.61 
 
 
609 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 
603 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  50.51 
 
 
605 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  51.45 
 
 
600 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  52.14 
 
 
602 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
603 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1081  GTP-binding protein  51.41 
 
 
622 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00893132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
603 aa  607  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 
605 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  52.14 
 
 
597 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  51.02 
 
 
597 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  52.14 
 
 
597 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  48.93 
 
 
608 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
606 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 
593 aa  606  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  51.02 
 
 
597 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  49.67 
 
 
605 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  52.39 
 
 
601 aa  605  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 
600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  51.61 
 
 
599 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  51.7 
 
 
601 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  52.03 
 
 
594 aa  605  1.0000000000000001e-171  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 
598 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 
608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  50.75 
 
 
622 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  51.7 
 
 
596 aa  602  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
608 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  52.13 
 
 
608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
601 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
608 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  51.34 
 
 
609 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.36 
 
 
601 aa  598  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  51.01 
 
 
598 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 
610 aa  601  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  49.24 
 
 
603 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51.96 
 
 
608 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  52.29 
 
 
596 aa  598  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>