More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4575 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  53.82 
 
 
607 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  53.82 
 
 
607 aa  654    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 
609 aa  685    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  55.05 
 
 
598 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  53.24 
 
 
609 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  55.07 
 
 
610 aa  668    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  55.48 
 
 
596 aa  661    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 
608 aa  655    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  54.19 
 
 
604 aa  651    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  56.28 
 
 
606 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  53.78 
 
 
614 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 
607 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
603 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  50.91 
 
 
613 aa  636    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  57.14 
 
 
608 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  53.86 
 
 
603 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 
607 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  53.78 
 
 
614 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  53.78 
 
 
614 aa  657    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  53.78 
 
 
614 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  57.31 
 
 
608 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 
615 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 
606 aa  696    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  68.94 
 
 
627 aa  867    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
609 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  53.02 
 
 
607 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  52.82 
 
 
598 aa  644    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  53.42 
 
 
598 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  56.38 
 
 
606 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  53.82 
 
 
607 aa  654    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  53.45 
 
 
610 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  69.1 
 
 
613 aa  871    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.31 
 
 
596 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  57.31 
 
 
608 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  55.13 
 
 
609 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  57.57 
 
 
608 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  53.82 
 
 
607 aa  654    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.37 
 
 
602 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  57.55 
 
 
608 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  57.14 
 
 
608 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
600 aa  653    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  54.25 
 
 
600 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  56.16 
 
 
602 aa  664    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.04 
 
 
598 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  54.05 
 
 
622 aa  686    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 
607 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  53.78 
 
 
614 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
609 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  52.99 
 
 
598 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  53.12 
 
 
597 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 
603 aa  676    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 
615 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  56.78 
 
 
592 aa  668    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  56.98 
 
 
608 aa  670    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  53.22 
 
 
615 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  53.82 
 
 
607 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  52.82 
 
 
598 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  53.82 
 
 
607 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  55.37 
 
 
614 aa  702    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  57.5 
 
 
608 aa  688    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  53.42 
 
 
608 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43212  predicted protein  57.14 
 
 
602 aa  682    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0723901  normal  0.0385264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 
602 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  52.32 
 
 
607 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  56.71 
 
 
608 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 
603 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  54.09 
 
 
609 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 
603 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  53.25 
 
 
600 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  54.86 
 
 
599 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  55.2 
 
 
607 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  54.59 
 
 
605 aa  658    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 
593 aa  671    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  53.02 
 
 
607 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 
603 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  57.72 
 
 
608 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  53.86 
 
 
623 aa  648    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 
599 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  54.35 
 
 
610 aa  665    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 
610 aa  661    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
607 aa  1244    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  53.42 
 
 
596 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 
603 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 
603 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 
602 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 
603 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  53.02 
 
 
607 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  57.89 
 
 
608 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  52.35 
 
 
605 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  51.98 
 
 
613 aa  640    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  57.31 
 
 
608 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  57.72 
 
 
608 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  53.25 
 
 
598 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  53.78 
 
 
614 aa  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  57.72 
 
 
608 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 
594 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  54.44 
 
 
614 aa  662    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
603 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  57.31 
 
 
608 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 
601 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>