More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3484 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  52.07 
 
 		 607 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 		 607 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  52.97 
 
 		 610 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  57.83 
 
 		 598 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  53.8 
 
 		 608 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  53.12 
 
 		 615 aa  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  63.06 
 
 		 614 aa  798    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  51.83 
 
 		 609 aa  643    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  53.99 
 
 		 606 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 		 614 aa  678    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  55.31 
 
 		 600 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 		 602 aa  661    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  52.79 
 
 		 613 aa  667    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  54.73 
 
 		 603 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 		 614 aa  678    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  52.78 
 
 		 614 aa  678    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  56.72 
 
 		 601 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  52.78 
 
 		 614 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 608 aa  1234    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  55.39 
 
 		 598 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 613 aa  648    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  57.07 
 
 		 596 aa  672    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  51.48 
 
 		 616 aa  645    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  51.71 
 
 		 615 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  53.61 
 
 		 598 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  53.91 
 
 		 606 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 		 603 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  54.46 
 
 		 610 aa  670    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  51.57 
 
 		 614 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.39 
 
 		 596 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  52.07 
 
 		 607 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 		 605 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  51.66 
 
 		 627 aa  638    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  57.28 
 
 		 602 aa  715    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  53.08 
 
 		 608 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  54.44 
 
 		 610 aa  682    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  54.21 
 
 		 600 aa  659    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 		 608 aa  672    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  54.88 
 
 		 602 aa  663    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  58.17 
 
 		 598 aa  700    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  52.4 
 
 		 600 aa  645    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  52.16 
 
 		 600 aa  638    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 		 614 aa  678    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 		 600 aa  657    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  55.56 
 
 		 598 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  54.61 
 
 		 597 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 		 603 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 607 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  56.59 
 
 		 592 aa  697    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  53.58 
 
 		 608 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  50.49 
 
 		 615 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  54.3 
 
 		 604 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  52.62 
 
 		 614 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 609 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 		 602 aa  659    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  53.7 
 
 		 600 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  53.45 
 
 		 598 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  52.47 
 
 		 615 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  54.24 
 
 		 602 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  54.14 
 
 		 609 aa  641    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 		 607 aa  655    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  54.23 
 
 		 607 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 		 614 aa  678    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  53.58 
 
 		 608 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  56.32 
 
 		 608 aa  704    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  55.02 
 
 		 599 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  55.28 
 
 		 605 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  52.07 
 
 		 607 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  57.83 
 
 		 599 aa  704    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  54.21 
 
 		 610 aa  664    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  54.04 
 
 		 623 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 		 602 aa  662    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  62.23 
 
 		 610 aa  772    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  62.4 
 
 		 610 aa  771    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 		 609 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  56.56 
 
 		 596 aa  677    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 		 603 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 		 603 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  53.65 
 
 		 602 aa  654    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  54.06 
 
 		 603 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  55.39 
 
 		 598 aa  667    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  53.08 
 
 		 608 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  62.11 
 
 		 606 aa  777    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  52.71 
 
 		 613 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  52.89 
 
 		 608 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  51.4 
 
 		 618 aa  642    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  52.94 
 
 		 614 aa  679    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  52.53 
 
 		 615 aa  660    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 		 594 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  52.47 
 
 		 615 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 		 603 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>