More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2868 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  52.99 
 
 		 607 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 607 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  56.83 
 
 		 608 aa  685    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 		 598 aa  651    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 614 aa  642    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  56.14 
 
 		 608 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  55.21 
 
 		 606 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  62.18 
 
 		 608 aa  759    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  54.41 
 
 		 636 aa  639    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 614 aa  643    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  53.38 
 
 		 600 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  53.15 
 
 		 607 aa  636    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  56.71 
 
 		 613 aa  668    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  52.79 
 
 		 613 aa  635    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  58.75 
 
 		 594 aa  708    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 614 aa  643    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  53.63 
 
 		 614 aa  643    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  53.63 
 
 		 614 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 608 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  55.99 
 
 		 616 aa  676    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  54.97 
 
 		 641 aa  656    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  52.99 
 
 		 607 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 608 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 608 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  57.1 
 
 		 650 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  55.16 
 
 		 630 aa  651    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 		 608 aa  664    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 		 608 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 614 aa  643    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  58.77 
 
 		 614 aa  709    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  55.08 
 
 		 627 aa  646    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 608 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  56.41 
 
 		 609 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  54 
 
 		 606 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  57.75 
 
 		 602 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  55.97 
 
 		 608 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  51.62 
 
 		 607 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2717  GTP-binding protein TypA  54.48 
 
 		 613 aa  635    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  55.88 
 
 		 608 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5317  GTP-binding protein  52.99 
 
 		 607 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.818778  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.22 
 
 		 598 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  57.75 
 
 		 614 aa  688    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  53.83 
 
 		 610 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 614 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  53.46 
 
 		 614 aa  642    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 		 605 aa  692    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  54.97 
 
 		 622 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  54.1 
 
 		 603 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  55.97 
 
 		 608 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 592 aa  663    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  56.14 
 
 		 608 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  57.09 
 
 		 615 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  58.18 
 
 		 620 aa  685    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 		 607 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  52.64 
 
 		 607 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  54 
 
 		 607 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  52.64 
 
 		 607 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  52.64 
 
 		 607 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  54.07 
 
 		 599 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  55.12 
 
 		 608 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  51.62 
 
 		 607 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  56.93 
 
 		 616 aa  670    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  57.09 
 
 		 615 aa  671    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  51.62 
 
 		 607 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  57.09 
 
 		 610 aa  680    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  59.39 
 
 		 605 aa  720    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  56.07 
 
 		 593 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  56.22 
 
 		 606 aa  688    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 608 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  55.97 
 
 		 608 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  54.68 
 
 		 601 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  55.08 
 
 		 613 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 		 610 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.99 
 
 		 610 aa  650    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 608 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  55.12 
 
 		 608 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  52.99 
 
 		 607 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  52.99 
 
 		 607 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  52.64 
 
 		 607 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 612 aa  637    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  55.65 
 
 		 605 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 		 608 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  57.09 
 
 		 615 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 614 aa  645    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 614 aa  643    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 608 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 594 aa  1191    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 608 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  52.99 
 
 		 607 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  52.99 
 
 		 607 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  54.34 
 
 		 601 aa  639    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 		 631 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  52.99 
 
 		 607 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4397  GTP-binding protein  52.64 
 
 		 607 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  53.29 
 
 		 614 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  57.02 
 
 		 612 aa  672    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  57.51 
 
 		 613 aa  670    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 608 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  53.04 
 
 		 599 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1761  small GTP-binding protein  55.63 
 
 		 634 aa  639    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>