More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0227 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  52.4 
 
 
607 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 
607 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.96 
 
 
598 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  52.4 
 
 
607 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  53.73 
 
 
603 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 
602 aa  656    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 
608 aa  643    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  100 
 
 
609 aa  1238    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  54.21 
 
 
606 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 
614 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  52.83 
 
 
605 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.23 
 
 
602 aa  655    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  62.64 
 
 
608 aa  784    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  53.57 
 
 
603 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 
599 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 
614 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  51.4 
 
 
614 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  52.93 
 
 
615 aa  640    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  51.4 
 
 
614 aa  645    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  52.39 
 
 
608 aa  646    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  52.39 
 
 
608 aa  646    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  52.78 
 
 
615 aa  644    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  62.81 
 
 
615 aa  792    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  55.09 
 
 
601 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  52.4 
 
 
607 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 
606 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  77.32 
 
 
614 aa  979    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  54.04 
 
 
610 aa  667    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  61.35 
 
 
614 aa  785    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  62.71 
 
 
608 aa  781    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  53.08 
 
 
609 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  54.47 
 
 
609 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  61.79 
 
 
606 aa  798    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.32 
 
 
602 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  52.05 
 
 
610 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  62.98 
 
 
608 aa  790    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  52.16 
 
 
600 aa  645    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 
602 aa  656    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 
598 aa  678    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  62.48 
 
 
608 aa  782    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  52.66 
 
 
607 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 
614 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  62.52 
 
 
607 aa  782    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 
609 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0861  GTP-binding protein TypA  60.1 
 
 
610 aa  759    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 
605 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  65.17 
 
 
613 aa  785    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 
607 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 
608 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  62.69 
 
 
609 aa  774    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  52.07 
 
 
602 aa  644    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  62.58 
 
 
607 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  63.43 
 
 
614 aa  815    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0673  GTP-binding protein TypA  60.77 
 
 
596 aa  753    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  76.99 
 
 
614 aa  979    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  60.47 
 
 
606 aa  759    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  52.74 
 
 
607 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  61.25 
 
 
610 aa  789    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  62.13 
 
 
607 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  53.5 
 
 
602 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  61.79 
 
 
606 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 
608 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  52.74 
 
 
607 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
607 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  62.17 
 
 
608 aa  776    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  64.29 
 
 
627 aa  804    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  52.45 
 
 
615 aa  642    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  55.98 
 
 
607 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 
608 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 
614 aa  646    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  62.25 
 
 
606 aa  794    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  62.05 
 
 
610 aa  800    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  54.15 
 
 
608 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  53.73 
 
 
623 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  62.52 
 
 
607 aa  780    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  51.33 
 
 
600 aa  639    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  63.08 
 
 
608 aa  795    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  52.98 
 
 
606 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  62.52 
 
 
608 aa  786    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  53.9 
 
 
603 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  53.9 
 
 
603 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  51.92 
 
 
602 aa  635    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  53.9 
 
 
603 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 
608 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  52.16 
 
 
606 aa  650    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  62.52 
 
 
606 aa  793    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  53.55 
 
 
614 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  62.13 
 
 
606 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  53.16 
 
 
604 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  54.15 
 
 
608 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  51.07 
 
 
614 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  61.46 
 
 
605 aa  778    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>