More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1109 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 
615 aa  643    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  95.24 
 
 
609 aa  1201    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  52.24 
 
 
608 aa  640    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 
605 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 
616 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  52.94 
 
 
608 aa  635    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  58.21 
 
 
614 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  53.76 
 
 
603 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 
627 aa  689    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0552  GTP-binding elongation factor protein  53.9 
 
 
609 aa  648    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  54.05 
 
 
607 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 
603 aa  635    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  55.52 
 
 
609 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 
602 aa  648    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  56.57 
 
 
605 aa  700    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 
615 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  53.1 
 
 
600 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  55.39 
 
 
606 aa  688    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  53.18 
 
 
605 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  53.26 
 
 
609 aa  648    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  100 
 
 
622 aa  1273    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 
632 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 
592 aa  675    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  51.65 
 
 
615 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 
613 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0487  GTP-binding protein TypA  53.9 
 
 
609 aa  652    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 
610 aa  671    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1081  GTP-binding protein  95.98 
 
 
622 aa  1238    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00893132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  53.54 
 
 
605 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 
608 aa  635    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  53.92 
 
 
603 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  53.92 
 
 
603 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  56.16 
 
 
616 aa  684    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 
607 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  53.17 
 
 
603 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  54.09 
 
 
603 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2717  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 
613 aa  685    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  54.76 
 
 
602 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  52.67 
 
 
604 aa  638    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
603 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  52.23 
 
 
597 aa  631  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 
603 aa  632  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  52.95 
 
 
593 aa  632  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  52.23 
 
 
610 aa  633  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  52.11 
 
 
613 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 
603 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0312  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 
603 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  52.98 
 
 
609 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  52.98 
 
 
609 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 
609 aa  631  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  54.59 
 
 
602 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 
607 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 
610 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  53.02 
 
 
603 aa  631  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  52.3 
 
 
594 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.77 
 
 
601 aa  631  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  51.01 
 
 
608 aa  631  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 
614 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 
614 aa  626  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  51.54 
 
 
596 aa  627  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 
608 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 
608 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  53.51 
 
 
608 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  53.32 
 
 
608 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 
608 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 
608 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 
608 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 
608 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  52.68 
 
 
602 aa  623  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 
607 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  52.02 
 
 
598 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  51.54 
 
 
597 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 
614 aa  620  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  51.59 
 
 
606 aa  618  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
614 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  50.51 
 
 
597 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
614 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  50.41 
 
 
614 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  50.59 
 
 
599 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  51.71 
 
 
596 aa  619  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0153  GTP-binding protein TypA  51 
 
 
605 aa  620  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
614 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
603 aa  621  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 
608 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 
614 aa  621  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
614 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 
612 aa  621  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 
608 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
614 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  50.51 
 
 
597 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
615 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  50.74 
 
 
608 aa  619  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 
608 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  51.44 
 
 
608 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 
608 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 
608 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 
608 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 
611 aa  619  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
615 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 
605 aa  619  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>