More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1790 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  52.57 
 
 
607 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  52.57 
 
 
607 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 
609 aa  646    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  59.3 
 
 
598 aa  729    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  52.57 
 
 
607 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  54.53 
 
 
600 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  53.31 
 
 
615 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  53.73 
 
 
606 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  54.62 
 
 
598 aa  668    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  53.9 
 
 
609 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  57 
 
 
614 aa  717    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  53.88 
 
 
607 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 
602 aa  647    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  52.97 
 
 
613 aa  665    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 
608 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  54.17 
 
 
603 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  51.39 
 
 
614 aa  644    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  57 
 
 
614 aa  717    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  57 
 
 
614 aa  717    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 
603 aa  648    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  57 
 
 
614 aa  717    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 
608 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  57.21 
 
 
627 aa  713    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  53.17 
 
 
609 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  53.23 
 
 
609 aa  655    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  53.88 
 
 
615 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  54.09 
 
 
605 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  53.04 
 
 
650 aa  651    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 
598 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 
606 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  54.06 
 
 
610 aa  675    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  56.67 
 
 
614 aa  715    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.53 
 
 
596 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 
608 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  53.06 
 
 
609 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  53.73 
 
 
606 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  59.23 
 
 
602 aa  743    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 
608 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  54.52 
 
 
610 aa  686    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  55.1 
 
 
600 aa  679    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 
608 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  57.71 
 
 
602 aa  696    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  59.13 
 
 
598 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 
608 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 
607 aa  638    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  57 
 
 
614 aa  717    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  72.51 
 
 
608 aa  882    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  54.13 
 
 
598 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  57.05 
 
 
597 aa  694    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 
603 aa  679    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 
602 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  58.31 
 
 
592 aa  720    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  56.15 
 
 
608 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  54.77 
 
 
615 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  57.88 
 
 
596 aa  692    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 
608 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 
607 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  56.34 
 
 
600 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  54.62 
 
 
598 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 
608 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  55.69 
 
 
602 aa  666    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  52.5 
 
 
610 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  55.09 
 
 
608 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 
603 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  63.86 
 
 
614 aa  796    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  53.17 
 
 
609 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 
616 aa  692    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  53.88 
 
 
615 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  57.71 
 
 
613 aa  724    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  57.94 
 
 
605 aa  706    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  56.18 
 
 
593 aa  667    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  51.72 
 
 
610 aa  635    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  56.09 
 
 
608 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  52.91 
 
 
623 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  52.67 
 
 
603 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 
608 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  58.61 
 
 
610 aa  743    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  58.61 
 
 
610 aa  744    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0417  GTP-binding protein  53.73 
 
 
616 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  57.53 
 
 
596 aa  697    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 
603 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 
603 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  54 
 
 
602 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 
603 aa  657    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  52.24 
 
 
622 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 
608 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 
602 aa  643    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  52.39 
 
 
613 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  59.46 
 
 
599 aa  735    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  50.66 
 
 
618 aa  646    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  53.67 
 
 
604 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  53.78 
 
 
615 aa  671    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  56.09 
 
 
608 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  56.44 
 
 
594 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  53.09 
 
 
600 aa  650    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 
603 aa  668    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  53.5 
 
 
602 aa  650    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  58.5 
 
 
601 aa  725    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 
608 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  52.67 
 
 
602 aa  635    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>