More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1761 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1761  small GTP-binding protein  100 
 
 		 634 aa  1292    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  64.33 
 
 		 614 aa  805    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  68.67 
 
 		 612 aa  853    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.87 
 
 		 614 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  64.4 
 
 		 619 aa  809    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  53.89 
 
 		 605 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  66.22 
 
 		 613 aa  809    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  64.83 
 
 		 613 aa  811    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  65.44 
 
 		 608 aa  796    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 594 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  53.46 
 
 		 608 aa  651    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  52.26 
 
 		 602 aa  634  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 		 605 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  51.69 
 
 		 606 aa  626  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 610 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 594 aa  621  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 604 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 610 aa  614  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 616 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  49.66 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  52.09 
 
 		 615 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  51.92 
 
 		 615 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  50.68 
 
 		 592 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 607 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  50.59 
 
 		 601 aa  598  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 607 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 		 607 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  51.59 
 
 		 615 aa  602  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 608 aa  601  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 606 aa  599  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 		 601 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  51.68 
 
 		 609 aa  595  1e-169  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 605 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 632 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  51.77 
 
 		 605 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 600 aa  598  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  51.49 
 
 		 608 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 608 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 608 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 608 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 608 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 		 612 aa  597  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 601 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 599 aa  596  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  51.35 
 
 		 593 aa  596  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 610 aa  596  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 608 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  49.66 
 
 		 610 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  49.83 
 
 		 608 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 608 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  51 
 
 		 608 aa  596  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 608 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 616 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 608 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  49.43 
 
 		 614 aa  593  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  51.19 
 
 		 602 aa  592  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  50.58 
 
 		 621 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 614 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 		 606 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  49.66 
 
 		 610 aa  595  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  51.11 
 
 		 596 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  50.33 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 608 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  50 
 
 		 605 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  49.91 
 
 		 597 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  49.41 
 
 		 598 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 		 608 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 608 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 		 608 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  49.33 
 
 		 627 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  48.4 
 
 		 603 aa  591  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 606 aa  588  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 		 608 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 606 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 		 608 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 598 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 608 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 		 608 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  51.6 
 
 		 608 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 608 aa  591  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 		 608 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 608 aa  591  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 		 608 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 		 630 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  51.16 
 
 		 606 aa  586  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 606 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 606 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  50.91 
 
 		 613 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  50 
 
 		 605 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 		 606 aa  586  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 609 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  50.59 
 
 		 606 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 		 620 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  50.51 
 
 		 608 aa  585  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>