More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0343 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  57.48 
 
 
607 aa  679    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  57.48 
 
 
607 aa  679    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  55.74 
 
 
604 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.94 
 
 
598 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 
602 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  64.52 
 
 
606 aa  800    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  62.64 
 
 
610 aa  782    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  54.71 
 
 
606 aa  651    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  63.23 
 
 
609 aa  800    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  55.32 
 
 
606 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  80.43 
 
 
608 aa  1014    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  54.24 
 
 
605 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 
602 aa  640    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52.91 
 
 
602 aa  643    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  79.93 
 
 
608 aa  1007    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  55.57 
 
 
603 aa  643    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  54.5 
 
 
605 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  80.76 
 
 
608 aa  1025    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  54.53 
 
 
599 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  54.32 
 
 
601 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  65.77 
 
 
607 aa  808    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 
608 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  53.65 
 
 
608 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  53.65 
 
 
608 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
609 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  56.57 
 
 
607 aa  659    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  54.04 
 
 
613 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  53.28 
 
 
613 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 
606 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  63.46 
 
 
614 aa  802    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  56.51 
 
 
610 aa  695    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  78.62 
 
 
614 aa  1009    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 
608 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 
608 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  55.37 
 
 
609 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  55.04 
 
 
609 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  62.93 
 
 
606 aa  800    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.08 
 
 
602 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  56.62 
 
 
608 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 
610 aa  638    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  57.48 
 
 
607 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  56.57 
 
 
607 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  55.24 
 
 
610 aa  661    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 
598 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  80.59 
 
 
608 aa  1018    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  64.5 
 
 
615 aa  816    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
603 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 
608 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  79.21 
 
 
608 aa  1005    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 
608 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  55 
 
 
603 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  63.31 
 
 
605 aa  788    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  69.44 
 
 
613 aa  839    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  55.12 
 
 
607 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  56.27 
 
 
608 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 
609 aa  651    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  81.55 
 
 
607 aa  1011    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  64.16 
 
 
614 aa  817    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0673  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 
596 aa  691    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  63.12 
 
 
614 aa  803    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  62.05 
 
 
606 aa  775    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 
606 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  81.55 
 
 
607 aa  1025    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  56.43 
 
 
602 aa  675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  54.32 
 
 
602 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  55.57 
 
 
608 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  54.49 
 
 
603 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  81.38 
 
 
607 aa  1011    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  62.77 
 
 
606 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  81.68 
 
 
627 aa  1033    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  56.77 
 
 
607 aa  662    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  55.21 
 
 
607 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 
608 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  54.23 
 
 
606 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  62.15 
 
 
606 aa  789    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  65.85 
 
 
610 aa  833    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 
608 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  53.81 
 
 
623 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  80.72 
 
 
607 aa  1009    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  53.8 
 
 
609 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  57.02 
 
 
607 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  57.48 
 
 
607 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 
603 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 
614 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 
603 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 
603 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  79.61 
 
 
608 aa  1008    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
603 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 
606 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 
608 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  57.02 
 
 
608 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 
603 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  62.93 
 
 
606 aa  800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  54.97 
 
 
607 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 
608 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 
608 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
609 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  84.71 
 
 
609 aa  1030    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 
603 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  90.46 
 
 
608 aa  1119    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>