More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0693 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 
602 aa  641    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  52.16 
 
 
601 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 
598 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  52.5 
 
 
599 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 
605 aa  651    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  76.99 
 
 
609 aa  979    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  53.39 
 
 
608 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  59.57 
 
 
605 aa  748    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  62.96 
 
 
608 aa  801    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
602 aa  640    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  58.37 
 
 
606 aa  753    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  62.29 
 
 
608 aa  791    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  59.37 
 
 
606 aa  761    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  53.38 
 
 
608 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  61.09 
 
 
608 aa  786    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4219  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 
607 aa  638    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 
608 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  52.48 
 
 
608 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  52.48 
 
 
608 aa  640    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  60.5 
 
 
610 aa  756    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  61.65 
 
 
606 aa  787    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3029  GTP-binding protein TypA  62.4 
 
 
605 aa  795    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  59.7 
 
 
606 aa  748    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  62.88 
 
 
608 aa  793    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0412  GTP-binding protein TypA  61.92 
 
 
607 aa  786    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  96.25 
 
 
614 aa  1221    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  51.72 
 
 
610 aa  636    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  60.69 
 
 
614 aa  775    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 
608 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 
608 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  61.96 
 
 
608 aa  785    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  59.37 
 
 
606 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 
602 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  53.39 
 
 
608 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  61.99 
 
 
609 aa  771    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4031  GTP-binding protein TypA  63.04 
 
 
606 aa  762    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  61.66 
 
 
615 aa  775    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.83 
 
 
598 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4502  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 
607 aa  636    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1426  GTP-binding protein TypA  62.52 
 
 
608 aa  792    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0201967  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  62.96 
 
 
607 aa  796    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  63.12 
 
 
607 aa  803    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.2 
 
 
614 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 
605 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1215  GTP-binding protein TypA  62.69 
 
 
608 aa  796    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378082  normal  0.59958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  64.19 
 
 
613 aa  784    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  52.49 
 
 
601 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 
608 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  62.94 
 
 
608 aa  798    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 
607 aa  644    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  61.75 
 
 
607 aa  766    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  62.02 
 
 
614 aa  798    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0673  GTP-binding protein TypA  61.24 
 
 
596 aa  760    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
614 aa  1250    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  58.9 
 
 
606 aa  731    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  61.34 
 
 
607 aa  770    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  53.39 
 
 
607 aa  642    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  62.83 
 
 
607 aa  787    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  62.46 
 
 
621 aa  792    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  62.52 
 
 
608 aa  792    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  62.15 
 
 
607 aa  791    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  62.09 
 
 
607 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3710  GTP-binding protein TypA  62.29 
 
 
606 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  62.87 
 
 
627 aa  797    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0730  hypothetical protein  65 
 
 
606 aa  795    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.85881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01592  BipA protein  52.47 
 
 
610 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
608 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 
608 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  60.96 
 
 
606 aa  764    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  60.6 
 
 
610 aa  775    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 
623 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  63.48 
 
 
607 aa  788    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 
601 aa  651    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 
632 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 
602 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 
608 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  60.17 
 
 
607 aa  767    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 
603 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 
603 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0861  GTP-binding protein TypA  57.78 
 
 
610 aa  723    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 
608 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
608 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 
609 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
602 aa  641    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 
603 aa  635    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 
608 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  54.61 
 
 
608 aa  671    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 
605 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 
600 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  52.98 
 
 
605 aa  651    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 
599 aa  633  1e-180  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  52.9 
 
 
603 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 
610 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 
609 aa  634  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  51.75 
 
 
609 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  53.06 
 
 
608 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  53.06 
 
 
608 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 
603 aa  631  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 
607 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  53.06 
 
 
608 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>