More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1533 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  56.45 
 
 		 608 aa  716    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  76.74 
 
 		 613 aa  969    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  53.07 
 
 		 617 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.71 
 
 		 614 aa  671    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  77.65 
 
 		 608 aa  970    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  56.71 
 
 		 594 aa  673    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  75.12 
 
 		 612 aa  965    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 		 615 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1761  small GTP-binding protein  64.71 
 
 		 634 aa  806    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 614 aa  1256    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  52.05 
 
 		 613 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  52.67 
 
 		 632 aa  643    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  54.14 
 
 		 608 aa  665    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  68.2 
 
 		 613 aa  869    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  53.64 
 
 		 592 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  53.78 
 
 		 615 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  52.36 
 
 		 620 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 		 615 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  53.12 
 
 		 616 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  56.88 
 
 		 605 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  54.53 
 
 		 605 aa  665    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  54.73 
 
 		 617 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  71.14 
 
 		 619 aa  910    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  52.76 
 
 		 605 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  57.75 
 
 		 594 aa  689    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  53.12 
 
 		 608 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 606 aa  657    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 604 aa  631  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 602 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  51.55 
 
 		 617 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 		 610 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 616 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 620 aa  630  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 		 607 aa  628  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 		 630 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  52.94 
 
 		 630 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 		 608 aa  629  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 610 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 610 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 603 aa  630  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  54.19 
 
 		 595 aa  628  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 608 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  51.81 
 
 		 605 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 		 614 aa  624  1e-177  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  52.93 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 607 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  52.27 
 
 		 607 aa  622  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50.74 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  51.84 
 
 		 600 aa  623  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 607 aa  623  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  53.43 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  52.09 
 
 		 601 aa  624  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  50.66 
 
 		 609 aa  621  1e-176  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  51.72 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 		 609 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  52.76 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  51.29 
 
 		 641 aa  621  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  51.49 
 
 		 607 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  52.76 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  52.36 
 
 		 607 aa  620  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  52.76 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 605 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  52.26 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 598 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 		 608 aa  618  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  51.54 
 
 		 622 aa  618  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 610 aa  618  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  52.26 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 		 606 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 		 595 aa  614  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  51.63 
 
 		 650 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  51.76 
 
 		 621 aa  615  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  50.72 
 
 		 629 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  51.5 
 
 		 604 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  51.15 
 
 		 614 aa  612  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  50.91 
 
 		 606 aa  612  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 608 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 		 603 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 		 603 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 602 aa  613  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  51.26 
 
 		 599 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 		 603 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  50.74 
 
 		 609 aa  611  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 601 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  51.27 
 
 		 613 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 608 aa  608  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01592  BipA protein  51.31 
 
 		 610 aa  610  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 603 aa  609  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  50.91 
 
 		 608 aa  609  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  51.48 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>