More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1650 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  60.4 
 
 		 621 aa  763    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4031  GTP-binding protein TypA  59.87 
 
 		 606 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 		 601 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.18 
 
 		 598 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3710  GTP-binding protein TypA  59.87 
 
 		 606 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  55.99 
 
 		 606 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  56.18 
 
 		 608 aa  675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  62.98 
 
 		 606 aa  795    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  60.47 
 
 		 609 aa  759    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  56.16 
 
 		 606 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1426  GTP-binding protein TypA  61.78 
 
 		 608 aa  766    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0201967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  55.85 
 
 		 608 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.8 
 
 		 602 aa  656    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 		 608 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  62.05 
 
 		 608 aa  778    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0412  GTP-binding protein TypA  59.9 
 
 		 607 aa  754    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  60.89 
 
 		 607 aa  757    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  64.14 
 
 		 607 aa  797    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01592  BipA protein  53.57 
 
 		 610 aa  646    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 		 608 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3029  GTP-binding protein TypA  62.75 
 
 		 605 aa  790    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 		 608 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0730  hypothetical protein  60.36 
 
 		 606 aa  733    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.85881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1215  GTP-binding protein TypA  62.11 
 
 		 608 aa  771    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378082  normal  0.59958 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  56.29 
 
 		 608 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  55.99 
 
 		 606 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  54.34 
 
 		 613 aa  653    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  81.62 
 
 		 606 aa  1015    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  55.08 
 
 		 606 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  59.07 
 
 		 614 aa  733    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  55.41 
 
 		 610 aa  679    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  61.08 
 
 		 614 aa  773    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  62.05 
 
 		 608 aa  778    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 		 608 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  61.96 
 
 		 608 aa  765    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  81.46 
 
 		 606 aa  1014    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 		 602 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  55.85 
 
 		 608 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  53.39 
 
 		 605 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  62.27 
 
 		 609 aa  775    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  62.15 
 
 		 607 aa  776    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 		 608 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  53.18 
 
 		 598 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0861  GTP-binding protein TypA  64.03 
 
 		 610 aa  787    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  86.61 
 
 		 605 aa  1080    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 		 603 aa  645    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  64.07 
 
 		 610 aa  769    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  61.22 
 
 		 608 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  54.06 
 
 		 603 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 		 605 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  65.46 
 
 		 613 aa  778    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 		 601 aa  673    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 		 608 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  81.46 
 
 		 606 aa  1014    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  54.95 
 
 		 608 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  59.74 
 
 		 607 aa  740    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  61.48 
 
 		 614 aa  751    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0673  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 596 aa  648    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  58.9 
 
 		 614 aa  731    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 606 aa  1227    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  53.29 
 
 		 602 aa  660    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  56.29 
 
 		 608 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  60.07 
 
 		 607 aa  762    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 		 602 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  53.24 
 
 		 600 aa  652    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  55.04 
 
 		 608 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  63.8 
 
 		 615 aa  801    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  59.57 
 
 		 607 aa  740    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  53.3 
 
 		 610 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  60.6 
 
 		 627 aa  767    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  51.91 
 
 		 602 aa  647    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 607 aa  658    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  53.74 
 
 		 600 aa  653    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  52.8 
 
 		 602 aa  656    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  84.16 
 
 		 606 aa  1041    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  62.17 
 
 		 610 aa  758    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  55.85 
 
 		 608 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  61.96 
 
 		 607 aa  764    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  53.71 
 
 		 602 aa  650    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  63.61 
 
 		 607 aa  766    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  56.51 
 
 		 608 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  56.34 
 
 		 608 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 		 605 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  62.05 
 
 		 607 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  54.49 
 
 		 601 aa  669    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  61.78 
 
 		 608 aa  766    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  52.91 
 
 		 600 aa  651    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  56.18 
 
 		 608 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.18 
 
 		 599 aa  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52.96 
 
 		 602 aa  658    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  62.13 
 
 		 608 aa  769    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 614 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  81.46 
 
 		 606 aa  1025    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 		 605 aa  641    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  55.85 
 
 		 608 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  62.11 
 
 		 608 aa  780    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 599 aa  653    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 604 aa  632  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  52.65 
 
 		 623 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 605 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>