More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0673 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 		 605 aa  667    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  54.61 
 
 		 609 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0861  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 		 610 aa  655    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  60.77 
 
 		 609 aa  753    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0730  hypothetical protein  56.47 
 
 		 606 aa  682    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.85881 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  57.48 
 
 		 608 aa  690    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  56.81 
 
 		 608 aa  687    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  56.47 
 
 		 608 aa  680    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  52.93 
 
 		 607 aa  673    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  55.7 
 
 		 608 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 610 aa  679    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 		 607 aa  661    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3029  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 		 605 aa  666    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4031  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 606 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  61.07 
 
 		 614 aa  759    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  55.87 
 
 		 614 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0412  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 		 607 aa  678    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  53.43 
 
 		 606 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  53.43 
 
 		 606 aa  666    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  56.13 
 
 		 608 aa  672    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1426  GTP-binding protein TypA  54.52 
 
 		 608 aa  674    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0201967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 608 aa  675    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  57.64 
 
 		 613 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  54.13 
 
 		 615 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  53.43 
 
 		 606 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 607 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  53.99 
 
 		 614 aa  692    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0673  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 596 aa  1209    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  61.24 
 
 		 614 aa  760    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 606 aa  648    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1215  GTP-binding protein TypA  54.68 
 
 		 608 aa  678    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378082  normal  0.59958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 607 aa  682    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  55.57 
 
 		 607 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 607 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  56.38 
 
 		 627 aa  686    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3710  GTP-binding protein TypA  55.13 
 
 		 606 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  54.44 
 
 		 606 aa  671    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  54 
 
 		 610 aa  677    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  55.52 
 
 		 607 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  55.43 
 
 		 621 aa  679    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 		 607 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 		 607 aa  691    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 606 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  53.77 
 
 		 606 aa  661    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  54.52 
 
 		 608 aa  674    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 602 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 602 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 602 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 602 aa  600  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  50.59 
 
 		 610 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 610 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  48.15 
 
 		 614 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  50.42 
 
 		 602 aa  593  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  49.83 
 
 		 600 aa  591  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 605 aa  588  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  48.9 
 
 		 599 aa  591  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  48.75 
 
 		 605 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  50.67 
 
 		 602 aa  587  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  49.66 
 
 		 606 aa  587  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  49.58 
 
 		 600 aa  585  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  49.08 
 
 		 613 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 602 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 608 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 608 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 		 605 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 		 605 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1470  GTP-binding protein TypA  49.08 
 
 		 607 aa  581  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  48.26 
 
 		 600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 608 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 608 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 608 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 608 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  48.19 
 
 		 610 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 608 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 608 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 608 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  49.33 
 
 		 616 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 608 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 607 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 608 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  48.76 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  47.99 
 
 		 612 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  48.91 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  48.99 
 
 		 608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  48.76 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 		 608 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  49.08 
 
 		 607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4397  GTP-binding protein  48.91 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  48.76 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  48.76 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  48.76 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  48.91 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 608 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  48.91 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 608 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 		 608 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 608 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  48.76 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>