More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0861 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0412  GTP-binding protein TypA  62.71 
 
 
607 aa  790    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  62.21 
 
 
621 aa  778    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  60.88 
 
 
606 aa  775    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1426  GTP-binding protein TypA  63.37 
 
 
608 aa  793    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0201967  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  60.1 
 
 
609 aa  759    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  63.2 
 
 
608 aa  794    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0861  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
610 aa  1243    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  62.71 
 
 
608 aa  787    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3029  GTP-binding protein TypA  62.99 
 
 
605 aa  788    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  64.73 
 
 
607 aa  791    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  63.04 
 
 
608 aa  787    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  63.67 
 
 
608 aa  806    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  57.78 
 
 
614 aa  725    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  53.04 
 
 
610 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  62.71 
 
 
614 aa  786    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  66.01 
 
 
606 aa  822    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  66.01 
 
 
606 aa  822    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 
602 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  63.37 
 
 
607 aa  789    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  62.48 
 
 
607 aa  785    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  66.01 
 
 
606 aa  820    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  65.79 
 
 
615 aa  815    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  64.01 
 
 
610 aa  809    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  64.6 
 
 
613 aa  784    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  66.94 
 
 
606 aa  838    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  63.05 
 
 
607 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  64.25 
 
 
614 aa  798    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0673  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 
596 aa  655    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  57.78 
 
 
614 aa  723    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  64.03 
 
 
606 aa  787    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  62.07 
 
 
607 aa  800    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  63.55 
 
 
607 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  63.04 
 
 
608 aa  793    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1215  GTP-binding protein TypA  63.7 
 
 
608 aa  798    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378082  normal  0.59958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  62.73 
 
 
607 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  63.14 
 
 
627 aa  788    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0730  hypothetical protein  57.62 
 
 
606 aa  709    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.85881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  63.04 
 
 
608 aa  787    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  66.17 
 
 
606 aa  818    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  64.79 
 
 
610 aa  812    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3710  GTP-binding protein TypA  62.38 
 
 
606 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  63.01 
 
 
607 aa  792    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  63.12 
 
 
609 aa  795    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  62.31 
 
 
607 aa  785    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  63.37 
 
 
608 aa  793    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  64.53 
 
 
605 aa  800    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4031  GTP-binding protein TypA  61.88 
 
 
606 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  50.82 
 
 
614 aa  634  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  52.3 
 
 
602 aa  632  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  51.98 
 
 
601 aa  632  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  52.32 
 
 
598 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  52.3 
 
 
608 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  51.81 
 
 
605 aa  629  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  52.3 
 
 
608 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 
608 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 
608 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 
608 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 
608 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  52.37 
 
 
608 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  50.74 
 
 
602 aa  625  1e-178  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  50.57 
 
 
602 aa  626  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 
608 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 
608 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 
605 aa  625  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  52.37 
 
 
608 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 
608 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 
599 aa  626  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
602 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  52.54 
 
 
606 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
602 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  52.05 
 
 
608 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  51.49 
 
 
598 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  52.54 
 
 
606 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  52.05 
 
 
608 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  52.05 
 
 
608 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  52.05 
 
 
608 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  52.12 
 
 
606 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 
599 aa  619  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  51.62 
 
 
613 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 
600 aa  620  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 
609 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  51.97 
 
 
608 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  50.33 
 
 
602 aa  617  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 
601 aa  616  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  51.97 
 
 
606 aa  618  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02547  GTP-binding protein TypA  51.81 
 
 
609 aa  616  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.404241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 
601 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  52.65 
 
 
606 aa  616  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51.98 
 
 
608 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  51.56 
 
 
605 aa  618  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 
605 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 
606 aa  616  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 
607 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  51.98 
 
 
608 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 
600 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  51.49 
 
 
603 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  51.8 
 
 
607 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 
608 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  51.74 
 
 
603 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  50.82 
 
 
602 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>