More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1306 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  52.58 
 
 		 607 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 		 607 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.77 
 
 		 601 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  53.51 
 
 		 598 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  54.52 
 
 		 600 aa  676    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 		 608 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 		 606 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  63.5 
 
 		 609 aa  819    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  54.05 
 
 		 606 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 614 aa  643    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  53.29 
 
 		 609 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 		 602 aa  675    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  52.57 
 
 		 605 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  64.47 
 
 		 608 aa  810    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  67.84 
 
 		 607 aa  843    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  54.16 
 
 		 596 aa  635    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 614 aa  643    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  52.22 
 
 		 614 aa  643    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  52.22 
 
 		 614 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 		 608 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  54.05 
 
 		 608 aa  668    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  53.88 
 
 		 608 aa  667    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 		 602 aa  677    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  64.74 
 
 		 605 aa  800    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  52.95 
 
 		 613 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  63.08 
 
 		 608 aa  810    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 		 606 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  61 
 
 		 614 aa  773    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  53.53 
 
 		 610 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  64.01 
 
 		 614 aa  823    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0861  GTP-binding protein TypA  62.07 
 
 		 610 aa  800    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 		 608 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  54.46 
 
 		 609 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  66.07 
 
 		 615 aa  824    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  65.61 
 
 		 606 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.49 
 
 		 602 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  55.21 
 
 		 608 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  51.72 
 
 		 614 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 		 608 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  64.47 
 
 		 608 aa  813    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  62.09 
 
 		 608 aa  788    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 		 598 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 		 608 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 		 607 aa  643    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 614 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 607 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  53.51 
 
 		 602 aa  663    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 		 597 aa  643    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  53.33 
 
 		 603 aa  639    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  65.61 
 
 		 606 aa  818    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  67.38 
 
 		 613 aa  830    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  64.91 
 
 		 608 aa  815    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 608 aa  663    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  52.38 
 
 		 615 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  64.63 
 
 		 606 aa  804    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  61.86 
 
 		 607 aa  778    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  65.91 
 
 		 614 aa  830    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0673  GTP-binding protein TypA  52.93 
 
 		 596 aa  673    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  60.17 
 
 		 614 aa  767    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  64.14 
 
 		 606 aa  797    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 		 608 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  54.1 
 
 		 600 aa  669    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  61.36 
 
 		 607 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  53.94 
 
 		 602 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  52.84 
 
 		 599 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  55.37 
 
 		 608 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 		 608 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  61.86 
 
 		 607 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  54.56 
 
 		 610 aa  663    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  62.29 
 
 		 627 aa  795    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  80.83 
 
 		 610 aa  998    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  53.96 
 
 		 607 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 		 605 aa  643    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  54.85 
 
 		 593 aa  659    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  66.45 
 
 		 606 aa  822    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  67.27 
 
 		 610 aa  847    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  55.45 
 
 		 608 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  53.32 
 
 		 602 aa  640    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  63.41 
 
 		 607 aa  790    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 		 608 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  64.93 
 
 		 609 aa  808    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  53.32 
 
 		 602 aa  639    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 		 614 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  53.18 
 
 		 606 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  52.05 
 
 		 614 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  64.51 
 
 		 608 aa  806    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  54.24 
 
 		 602 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 		 616 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  54.08 
 
 		 608 aa  651    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  55.21 
 
 		 608 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  52.58 
 
 		 607 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  52.49 
 
 		 603 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  52.58 
 
 		 607 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 607 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 		 602 aa  676    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  64.09 
 
 		 608 aa  808    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  55.45 
 
 		 608 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  53.22 
 
 		 599 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 611 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  65.28 
 
 		 606 aa  815    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>