More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1998 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  61.61 
 
 		 607 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  61.61 
 
 		 607 aa  756    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2008  GTP-binding protein TypA  65.2 
 
 		 607 aa  815    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  55.89 
 
 		 598 aa  675    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  58.42 
 
 		 606 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  59.27 
 
 		 603 aa  735    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 615 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  60.89 
 
 		 606 aa  765    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  55.78 
 
 		 598 aa  675    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  71.38 
 
 		 606 aa  880    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  54.28 
 
 		 614 aa  680    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  59.38 
 
 		 605 aa  736    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  57.21 
 
 		 602 aa  697    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  52.72 
 
 		 613 aa  653    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 		 608 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  61.78 
 
 		 603 aa  753    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  58.42 
 
 		 606 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  54.28 
 
 		 614 aa  680    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  54.28 
 
 		 614 aa  680    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  58.15 
 
 		 602 aa  708    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  54.28 
 
 		 614 aa  680    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  72.74 
 
 		 608 aa  897    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  59.41 
 
 		 608 aa  729    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  59.41 
 
 		 608 aa  729    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  58.25 
 
 		 606 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  56.84 
 
 		 615 aa  705    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 613 aa  1241    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  55.99 
 
 		 598 aa  674    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  73.07 
 
 		 606 aa  898    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  55.54 
 
 		 600 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  71.27 
 
 		 610 aa  890    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  53.44 
 
 		 614 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.58 
 
 		 596 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  72.74 
 
 		 608 aa  897    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  62.05 
 
 		 609 aa  772    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  58.25 
 
 		 606 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  55.08 
 
 		 606 aa  671    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  56.95 
 
 		 602 aa  688    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  72.91 
 
 		 608 aa  896    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3380  GTP-binding protein TypA  66.02 
 
 		 608 aa  820    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465428  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  56 
 
 		 600 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  60.88 
 
 		 607 aa  745    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  57.62 
 
 		 602 aa  695    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  55.22 
 
 		 598 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  56.98 
 
 		 606 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  60.46 
 
 		 607 aa  748    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  54.28 
 
 		 614 aa  680    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  54.79 
 
 		 600 aa  678    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  55.61 
 
 		 598 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 		 597 aa  669    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  69.79 
 
 		 603 aa  889    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  62.71 
 
 		 604 aa  760    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  65.42 
 
 		 609 aa  818    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  58.25 
 
 		 596 aa  689    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  73.4 
 
 		 608 aa  902    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  52.63 
 
 		 615 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  55.68 
 
 		 601 aa  678    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  55.82 
 
 		 598 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  52.44 
 
 		 614 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  57.05 
 
 		 602 aa  696    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  54.34 
 
 		 606 aa  653    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2137  GTP-binding protein TypA  65.2 
 
 		 607 aa  810    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  58.94 
 
 		 608 aa  718    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  54.46 
 
 		 607 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  72.74 
 
 		 602 aa  890    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2429  GTP-binding protein TypA  65.37 
 
 		 607 aa  810    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.456233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  71.26 
 
 		 608 aa  877    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  61.72 
 
 		 603 aa  749    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  67.38 
 
 		 610 aa  824    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  58.46 
 
 		 608 aa  720    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  72.74 
 
 		 608 aa  897    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  57.17 
 
 		 615 aa  711    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  72.41 
 
 		 607 aa  887    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0153  GTP-binding protein TypA  59.21 
 
 		 605 aa  718    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.57 
 
 		 593 aa  669    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  55.25 
 
 		 606 aa  659    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 		 610 aa  644    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  73.07 
 
 		 608 aa  898    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  60.82 
 
 		 623 aa  765    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 		 607 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  54.38 
 
 		 608 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 		 610 aa  672    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  55.94 
 
 		 610 aa  672    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0417  GTP-binding protein  59.83 
 
 		 616 aa  723    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  57.74 
 
 		 596 aa  690    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  61.78 
 
 		 603 aa  751    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  61.78 
 
 		 603 aa  751    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  62.38 
 
 		 602 aa  772    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  61.12 
 
 		 603 aa  742    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  60.73 
 
 		 608 aa  760    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  72.58 
 
 		 608 aa  894    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  58.75 
 
 		 605 aa  727    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  52.55 
 
 		 613 aa  648    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2746  GTP-binding protein TypA  65.96 
 
 		 607 aa  812    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.163334  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  51.98 
 
 		 618 aa  643    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  56.04 
 
 		 600 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  52.72 
 
 		 615 aa  651    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  73.07 
 
 		 608 aa  898    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  72.74 
 
 		 608 aa  897    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  63.2 
 
 		 611 aa  772    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>