More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2976 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  56.19 
 
 		 607 aa  661    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  56.19 
 
 		 607 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3380  GTP-binding protein TypA  54.06 
 
 		 608 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465428  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.61 
 
 		 598 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  56.19 
 
 		 607 aa  661    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  55.24 
 
 		 607 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 		 609 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 606 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  62.17 
 
 		 609 aa  776    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  55.17 
 
 		 606 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  55.93 
 
 		 610 aa  668    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 		 605 aa  644    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 602 aa  653    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 		 603 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  88.16 
 
 		 608 aa  1104    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  55.59 
 
 		 603 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  78.45 
 
 		 608 aa  994    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  63.31 
 
 		 610 aa  783    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.66 
 
 		 614 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  55.09 
 
 		 604 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 608 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 608 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  54.21 
 
 		 608 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  54.3 
 
 		 608 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  89.31 
 
 		 608 aa  1113    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  66 
 
 		 607 aa  814    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2008  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 		 607 aa  651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  56.17 
 
 		 606 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  62.54 
 
 		 614 aa  789    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 		 610 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  78.48 
 
 		 614 aa  988    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  85.21 
 
 		 609 aa  1045    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 608 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  54.55 
 
 		 609 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  54.82 
 
 		 609 aa  656    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  62.64 
 
 		 606 aa  786    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 		 602 aa  663    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  56.67 
 
 		 608 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  56.19 
 
 		 607 aa  661    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  86.28 
 
 		 608 aa  1082    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  53.34 
 
 		 608 aa  636    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 		 607 aa  656    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.68 
 
 		 598 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  53.97 
 
 		 605 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 607 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  62.64 
 
 		 606 aa  786    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 		 603 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  53.97 
 
 		 602 aa  651    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  54.23 
 
 		 605 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 		 603 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  64.26 
 
 		 606 aa  794    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  69.14 
 
 		 613 aa  832    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 		 606 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 608 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  54.14 
 
 		 602 aa  653    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  77.59 
 
 		 607 aa  966    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  63.13 
 
 		 614 aa  808    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0673  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 596 aa  675    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  62.88 
 
 		 614 aa  793    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  61.96 
 
 		 606 aa  765    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2137  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 		 607 aa  648    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  53.59 
 
 		 602 aa  637    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  77.92 
 
 		 607 aa  994    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 		 602 aa  647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2429  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 		 607 aa  638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.456233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  56.59 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 		 603 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  78.25 
 
 		 607 aa  972    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  56.19 
 
 		 609 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  79.93 
 
 		 627 aa  996    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  88.65 
 
 		 608 aa  1112    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  55.41 
 
 		 607 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 608 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 608 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  62.66 
 
 		 606 aa  790    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  64.92 
 
 		 610 aa  819    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  56.5 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 		 623 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  91.1 
 
 		 607 aa  1133    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  62.48 
 
 		 606 aa  784    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 608 aa  1229    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  54.15 
 
 		 607 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  55.02 
 
 		 606 aa  646    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 608 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 		 603 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 		 603 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  53.33 
 
 		 600 aa  637    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  55.09 
 
 		 603 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  63.46 
 
 		 615 aa  799    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  56.33 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  54.47 
 
 		 605 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 608 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  55.09 
 
 		 607 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 		 609 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  53.99 
 
 		 609 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  56.5 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  55.48 
 
 		 607 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  54.15 
 
 		 609 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 		 603 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  53.49 
 
 		 602 aa  635    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>