More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1010 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  52.69 
 
 		 617 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  67.87 
 
 		 613 aa  864    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  54.44 
 
 		 615 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 610 aa  640    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 604 aa  637    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  54.53 
 
 		 630 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 		 607 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  70.96 
 
 		 619 aa  895    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  54.47 
 
 		 617 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  53.97 
 
 		 608 aa  664    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 		 605 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  53.35 
 
 		 630 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  76.66 
 
 		 614 aa  969    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 608 aa  638    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  53.3 
 
 		 607 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.23 
 
 		 614 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  54.11 
 
 		 615 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 		 620 aa  661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  78.64 
 
 		 608 aa  976    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  53.38 
 
 		 607 aa  653    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  53.94 
 
 		 605 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  54.97 
 
 		 613 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  57.8 
 
 		 594 aa  684    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  57.77 
 
 		 605 aa  693    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  82.49 
 
 		 612 aa  1035    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  53.92 
 
 		 617 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 607 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 613 aa  1243    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  54.11 
 
 		 616 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  58.12 
 
 		 608 aa  721    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  52.73 
 
 		 606 aa  653    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  53.94 
 
 		 632 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  57.51 
 
 		 594 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  54.44 
 
 		 615 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1761  small GTP-binding protein  66.22 
 
 		 634 aa  810    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  52.76 
 
 		 607 aa  631  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  52.72 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  52.55 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  52.19 
 
 		 620 aa  632  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  51.46 
 
 		 641 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 605 aa  632  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50.16 
 
 		 608 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  51.66 
 
 		 609 aa  630  1e-179  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  53.51 
 
 		 606 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  52.32 
 
 		 610 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  52.32 
 
 		 621 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 608 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  51.48 
 
 		 610 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  52.85 
 
 		 624 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  53.36 
 
 		 608 aa  631  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 620 aa  628  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 608 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 608 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0412  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 		 607 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 603 aa  625  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 608 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 608 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  51.93 
 
 		 629 aa  626  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 608 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 		 609 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  53.34 
 
 		 606 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 608 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  52.23 
 
 		 606 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 608 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  52.82 
 
 		 627 aa  625  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 610 aa  628  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1215  GTP-binding protein TypA  52.35 
 
 		 608 aa  625  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378082  normal  0.59958 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 608 aa  627  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  52.39 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  53.21 
 
 		 608 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 598 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  52.93 
 
 		 606 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  51.94 
 
 		 650 aa  624  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  52 
 
 		 614 aa  623  1e-177  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  53.61 
 
 		 595 aa  622  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  53.92 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 		 614 aa  625  1e-177  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  51.35 
 
 		 600 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  53.1 
 
 		 608 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  53.92 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  51.45 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 608 aa  621  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  51.84 
 
 		 606 aa  621  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  53.1 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  53.1 
 
 		 606 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 		 610 aa  621  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 630 aa  621  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 		 602 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3710  GTP-binding protein TypA  53.73 
 
 		 606 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3029  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 		 605 aa  620  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  51.64 
 
 		 614 aa  619  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1426  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 608 aa  621  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0201967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  53.1 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  52.93 
 
 		 607 aa  618  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 603 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 601 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  51.07 
 
 		 609 aa  617  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>