More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0318 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  54.77 
 
 		 607 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  54.77 
 
 		 607 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 		 627 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  55.65 
 
 		 598 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  55.87 
 
 		 606 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  53.1 
 
 		 599 aa  639    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  56.11 
 
 		 608 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 606 aa  651    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  55.87 
 
 		 607 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  56.95 
 
 		 606 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 614 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  56.38 
 
 		 609 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  54.12 
 
 		 602 aa  640    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 		 616 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 		 606 aa  661    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  55.37 
 
 		 603 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 603 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 614 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  53.09 
 
 		 614 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  53.09 
 
 		 614 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  56.28 
 
 		 608 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  54.61 
 
 		 608 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  54.61 
 
 		 608 aa  645    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  54.77 
 
 		 607 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  54.41 
 
 		 615 aa  645    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  54.64 
 
 		 613 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  56.11 
 
 		 608 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  55.87 
 
 		 606 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  56.62 
 
 		 606 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  55.61 
 
 		 602 aa  643    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  53.99 
 
 		 610 aa  635    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  55.29 
 
 		 603 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 609 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  56.28 
 
 		 608 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  57.62 
 
 		 609 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  55.2 
 
 		 606 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  55.09 
 
 		 613 aa  638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.45 
 
 		 602 aa  653    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  54.02 
 
 		 598 aa  636    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  53.98 
 
 		 600 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  55.78 
 
 		 602 aa  641    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  55.87 
 
 		 606 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  55.82 
 
 		 598 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  56.19 
 
 		 609 aa  646    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 		 607 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 614 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  56.28 
 
 		 608 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  54.19 
 
 		 598 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  56.46 
 
 		 597 aa  640    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  55.97 
 
 		 603 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  54.77 
 
 		 607 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  55.06 
 
 		 615 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  53.2 
 
 		 600 aa  642    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  54.74 
 
 		 615 aa  636    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  56.28 
 
 		 608 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 		 603 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  54.12 
 
 		 602 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  54.41 
 
 		 608 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  55.7 
 
 		 606 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  54.94 
 
 		 607 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 608 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 		 603 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  53.78 
 
 		 600 aa  647    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  54.17 
 
 		 599 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  56.95 
 
 		 614 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 		 615 aa  656    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  56.78 
 
 		 607 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 		 608 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  63.91 
 
 		 593 aa  783    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  56.28 
 
 		 608 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  56.11 
 
 		 604 aa  641    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  55.03 
 
 		 623 aa  660    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  56.28 
 
 		 605 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  54.02 
 
 		 598 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  56.21 
 
 		 610 aa  690    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  56.04 
 
 		 610 aa  688    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 609 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  54.77 
 
 		 607 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 		 603 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 		 603 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  58.29 
 
 		 602 aa  665    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 		 603 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  56.88 
 
 		 606 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  56.28 
 
 		 605 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 606 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  54.12 
 
 		 602 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  54.77 
 
 		 607 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  54.64 
 
 		 602 aa  659    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 614 aa  636    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  55.11 
 
 		 611 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  55.87 
 
 		 603 aa  648    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  54.88 
 
 		 602 aa  653    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  54.55 
 
 		 601 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 		 599 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>