More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0615 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  53.33 
 
 		 606 aa  658    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  53.07 
 
 		 611 aa  642    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 598 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 599 aa  1238    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.51 
 
 		 599 aa  643    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  70.85 
 
 		 601 aa  876    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  68.18 
 
 		 598 aa  854    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 		 601 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  63.13 
 
 		 604 aa  801    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  52.17 
 
 		 603 aa  655    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 		 601 aa  643    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  56.21 
 
 		 602 aa  680    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  52.08 
 
 		 600 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  53.31 
 
 		 600 aa  644    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 		 602 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 		 598 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  52.26 
 
 		 627 aa  638    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  51.96 
 
 		 592 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  65.66 
 
 		 604 aa  831    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  67.79 
 
 		 598 aa  858    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  52 
 
 		 604 aa  642    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  53.1 
 
 		 595 aa  639    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  53.58 
 
 		 600 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  53.39 
 
 		 599 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 		 605 aa  656    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  53.6 
 
 		 614 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  56.16 
 
 		 593 aa  677    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 610 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  65.11 
 
 		 602 aa  826    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 		 596 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  67 
 
 		 604 aa  839    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 		 616 aa  646    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  64.2 
 
 		 599 aa  821    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 603 aa  640    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  53.34 
 
 		 595 aa  633  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 		 596 aa  634  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  51.6 
 
 		 596 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 603 aa  629  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 		 597 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  51.25 
 
 		 603 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  52.76 
 
 		 608 aa  629  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  52.09 
 
 		 613 aa  631  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  52.51 
 
 		 601 aa  631  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 		 632 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  53.01 
 
 		 608 aa  628  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 610 aa  627  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 		 605 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 614 aa  623  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  51.94 
 
 		 598 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.29 
 
 		 596 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  52.34 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  51.94 
 
 		 598 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  51.53 
 
 		 597 aa  624  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  52.83 
 
 		 623 aa  624  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  51.52 
 
 		 613 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 604 aa  622  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 614 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 614 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 614 aa  621  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 614 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  50.58 
 
 		 614 aa  621  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  50.58 
 
 		 614 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 614 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 614 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  51.78 
 
 		 598 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  51.61 
 
 		 598 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  51.61 
 
 		 598 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  52.34 
 
 		 610 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 610 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 614 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  51.71 
 
 		 597 aa  618  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 614 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 		 614 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 		 612 aa  615  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  52 
 
 		 606 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  51.71 
 
 		 597 aa  618  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  51.02 
 
 		 600 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  51.08 
 
 		 602 aa  615  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  49.25 
 
 		 600 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  51.08 
 
 		 602 aa  614  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 605 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  52.24 
 
 		 603 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  52.24 
 
 		 603 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 609 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  49.66 
 
 		 608 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 608 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1081  GTP-binding protein  49.92 
 
 		 622 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00893132  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 608 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  51.74 
 
 		 604 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 608 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  49.33 
 
 		 602 aa  611  1e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 608 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 608 aa  611  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 608 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 608 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 608 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 		 603 aa  608  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>