More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0844 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  66.39 
 
 		 601 aa  837    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  55.82 
 
 		 598 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  63.13 
 
 		 599 aa  801    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  69.71 
 
 		 599 aa  866    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  52.75 
 
 		 603 aa  647    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  65.55 
 
 		 598 aa  828    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  69.97 
 
 		 604 aa  849    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 601 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  65.55 
 
 		 598 aa  836    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 601 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 604 aa  1243    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 		 614 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  54.03 
 
 		 600 aa  652    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  53.48 
 
 		 608 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  53.64 
 
 		 610 aa  671    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  56.62 
 
 		 602 aa  691    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 600 aa  644    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  55.99 
 
 		 602 aa  650    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  56.54 
 
 		 598 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  71.21 
 
 		 604 aa  867    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  52.58 
 
 		 604 aa  637    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  54.97 
 
 		 600 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 608 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 595 aa  637    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  54.71 
 
 		 599 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  53.73 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 608 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 		 616 aa  641    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  53.03 
 
 		 593 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  67.68 
 
 		 602 aa  828    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.91 
 
 		 605 aa  653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  54.71 
 
 		 608 aa  656    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 		 603 aa  640    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 		 611 aa  659    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  53.51 
 
 		 606 aa  650    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  53.73 
 
 		 608 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  54.03 
 
 		 601 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  53.92 
 
 		 596 aa  634  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 		 632 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 		 608 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 		 608 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 		 605 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 		 608 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  52.24 
 
 		 610 aa  630  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  53.74 
 
 		 599 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 		 603 aa  631  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  53.42 
 
 		 608 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  52.35 
 
 		 610 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  52.35 
 
 		 610 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 603 aa  629  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  52.42 
 
 		 595 aa  626  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 		 596 aa  626  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  53.68 
 
 		 598 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  53.5 
 
 		 598 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 		 597 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  51.79 
 
 		 592 aa  622  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 		 597 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 602 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  53.68 
 
 		 598 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  52.2 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 609 aa  618  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  51.74 
 
 		 613 aa  620  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.98 
 
 		 596 aa  621  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  53.5 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 605 aa  619  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 607 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  51.52 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  52.12 
 
 		 597 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  52.12 
 
 		 597 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  51.5 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4397  GTP-binding protein  51.5 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 		 598 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  51.5 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  51.66 
 
 		 606 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 610 aa  616  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3029  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 605 aa  615  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  53.33 
 
 		 598 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  51.5 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  51.34 
 
 		 610 aa  616  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  51.5 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  50.91 
 
 		 607 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  52.39 
 
 		 594 aa  614  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 602 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 627 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 608 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  50.92 
 
 		 607 aa  612  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>