More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4935 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  52.18 
 
 
603 aa  639    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  52.94 
 
 
598 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  67.79 
 
 
599 aa  858    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  80.9 
 
 
601 aa  1011    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  54.85 
 
 
606 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
598 aa  1221    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  53.11 
 
 
600 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  86.22 
 
 
598 aa  1062    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  69.63 
 
 
604 aa  872    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 
627 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  54.36 
 
 
610 aa  667    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 
606 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
602 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 
600 aa  636    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  53.78 
 
 
598 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  65.55 
 
 
604 aa  828    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  53.19 
 
 
604 aa  642    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.51 
 
 
614 aa  655    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  53.01 
 
 
605 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  52.84 
 
 
611 aa  647    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.5 
 
 
593 aa  677    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  53.43 
 
 
616 aa  648    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  52.94 
 
 
599 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  69.58 
 
 
602 aa  865    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  53.45 
 
 
610 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.61 
 
 
610 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  68.68 
 
 
604 aa  850    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  70.57 
 
 
599 aa  895    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  54.03 
 
 
603 aa  660    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.11 
 
 
601 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  52.94 
 
 
608 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  52.47 
 
 
602 aa  634  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 
603 aa  631  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  51.79 
 
 
600 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  53.26 
 
 
606 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 
601 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  51.26 
 
 
608 aa  630  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 
604 aa  630  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  52.25 
 
 
605 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 
606 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  53.26 
 
 
606 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  51.01 
 
 
613 aa  626  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 
603 aa  626  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  53.26 
 
 
606 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 
606 aa  626  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  51.84 
 
 
595 aa  624  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 
606 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  50.76 
 
 
601 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 
606 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  52.22 
 
 
599 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  51.53 
 
 
598 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  51.7 
 
 
598 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
610 aa  619  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  51.43 
 
 
595 aa  619  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  50.84 
 
 
598 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  51.11 
 
 
597 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  51.54 
 
 
600 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
605 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  51.7 
 
 
598 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  52.68 
 
 
632 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  51.7 
 
 
598 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  51.86 
 
 
608 aa  616  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 
602 aa  615  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 
608 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  51.28 
 
 
596 aa  615  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
613 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  51.59 
 
 
604 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 
610 aa  615  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
592 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
608 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 
608 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
608 aa  617  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  52.25 
 
 
605 aa  618  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 
608 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  50.59 
 
 
602 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 
608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 
608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 
608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.11 
 
 
596 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 
608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 
608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 
608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  52.09 
 
 
603 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  50.76 
 
 
602 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 
608 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 
614 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 
602 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  49.92 
 
 
600 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 
608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  50.6 
 
 
596 aa  614  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 
605 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 
615 aa  614  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 
614 aa  610  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  50.5 
 
 
615 aa  609  1e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
608 aa  610  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 
614 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 
602 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  49.08 
 
 
614 aa  608  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 
614 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
602 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>