More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00185 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  81.48 
 
 		 601 aa  1008    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 		 598 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  68.18 
 
 		 599 aa  854    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  52.19 
 
 		 603 aa  635    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  52.84 
 
 		 605 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  68.18 
 
 		 604 aa  847    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  54.09 
 
 		 611 aa  657    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 		 604 aa  640    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  54.12 
 
 		 606 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 		 602 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  51.43 
 
 		 600 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  54.53 
 
 		 616 aa  662    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  52.82 
 
 		 602 aa  647    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  53.95 
 
 		 598 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  53.03 
 
 		 603 aa  655    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  51.18 
 
 		 603 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  51.1 
 
 		 600 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  52.21 
 
 		 599 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.93 
 
 		 605 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 		 614 aa  661    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  53.6 
 
 		 610 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  54.61 
 
 		 606 aa  656    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  86.22 
 
 		 598 aa  1062    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  53.54 
 
 		 604 aa  645    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.35 
 
 		 601 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 		 593 aa  679    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  65.55 
 
 		 604 aa  836    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 		 606 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  68.41 
 
 		 602 aa  846    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  52.85 
 
 		 610 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.02 
 
 		 610 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  100 
 
 		 598 aa  1225    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 		 602 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  68.8 
 
 		 604 aa  857    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  69.85 
 
 		 599 aa  873    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  51.94 
 
 		 600 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  51.35 
 
 		 601 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  52.95 
 
 		 601 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 603 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  53.11 
 
 		 606 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 		 598 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  51.53 
 
 		 598 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  51.86 
 
 		 598 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  51.86 
 
 		 598 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  52.63 
 
 		 598 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 597 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 610 aa  630  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  52.28 
 
 		 599 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 605 aa  629  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 		 603 aa  631  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  51.54 
 
 		 600 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  51.35 
 
 		 602 aa  629  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  51.6 
 
 		 607 aa  630  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  51.01 
 
 		 596 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  52.09 
 
 		 605 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 606 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  51.01 
 
 		 596 aa  625  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  52.77 
 
 		 606 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 613 aa  625  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 597 aa  625  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 608 aa  627  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  52.77 
 
 		 606 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  51.26 
 
 		 604 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 595 aa  624  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 632 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  50.66 
 
 		 615 aa  624  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  52.77 
 
 		 606 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.18 
 
 		 596 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 		 595 aa  624  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 605 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 		 606 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  52.94 
 
 		 606 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 609 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 597 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  50.17 
 
 		 602 aa  618  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 597 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 609 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  51.11 
 
 		 592 aa  620  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  49.66 
 
 		 596 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  52.61 
 
 		 606 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  50.17 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  51.09 
 
 		 600 aa  617  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  50.25 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  50.25 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 607 aa  616  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  50.17 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 608 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  50.25 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  50.17 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  50.25 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  50.76 
 
 		 603 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 627 aa  618  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 		 608 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5317  GTP-binding protein  50.17 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.818778  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  50.17 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>