More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0013 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  53.51 
 
 		 604 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  52.34 
 
 		 601 aa  647    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 600 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  52.19 
 
 		 598 aa  635    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0016  GTP-binding protein TypA  67.38 
 
 		 612 aa  852    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000119023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 603 aa  1229    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 614 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  52.18 
 
 		 598 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  82.06 
 
 		 604 aa  1039    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  84.91 
 
 		 603 aa  1061    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 		 598 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 		 604 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 599 aa  629  1e-179  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 603 aa  630  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 604 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 605 aa  627  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 		 601 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 		 601 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  50.59 
 
 		 598 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 		 599 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 606 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  51.26 
 
 		 599 aa  625  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 599 aa  620  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 		 608 aa  618  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 		 610 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  51.25 
 
 		 602 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  50.92 
 
 		 602 aa  619  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 601 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 613 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 602 aa  615  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  51 
 
 		 600 aa  617  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 610 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 602 aa  616  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 602 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  50.59 
 
 		 592 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 614 aa  618  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 602 aa  616  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 		 611 aa  617  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  51.25 
 
 		 602 aa  617  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 602 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 		 603 aa  615  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  51.66 
 
 		 608 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 607 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  51.33 
 
 		 602 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 615 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 627 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  51 
 
 		 600 aa  611  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 615 aa  608  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  611  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  51.25 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 615 aa  608  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 610 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 610 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 603 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  50.08 
 
 		 603 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  49.17 
 
 		 604 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  49.01 
 
 		 610 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  49.16 
 
 		 608 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  49 
 
 		 605 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 608 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 		 606 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 		 606 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 613 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 603 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  49.59 
 
 		 613 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  47.26 
 
 		 608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  49.17 
 
 		 609 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 		 609 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  49.17 
 
 		 603 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  48.5 
 
 		 616 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 		 608 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  47.63 
 
 		 612 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 		 608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  49.33 
 
 		 606 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  51.35 
 
 		 593 aa  602  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 603 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 603 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  49.33 
 
 		 603 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  49.92 
 
 		 605 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  49.26 
 
 		 615 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  50.85 
 
 		 594 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 		 606 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  48.6 
 
 		 607 aa  601  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  48.68 
 
 		 614 aa  600  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>