More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3399 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  67 
 
 		 599 aa  839    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.49 
 
 		 605 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 604 aa  1229    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  83.28 
 
 		 604 aa  1043    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  54.77 
 
 		 606 aa  655    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 602 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  71.21 
 
 		 604 aa  867    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  53.51 
 
 		 603 aa  647    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  51.91 
 
 		 614 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  53.37 
 
 		 603 aa  655    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  68.18 
 
 		 598 aa  847    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  54.5 
 
 		 611 aa  646    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  54.83 
 
 		 610 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  76.67 
 
 		 602 aa  949    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 610 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 610 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  69.44 
 
 		 601 aa  869    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  68.68 
 
 		 598 aa  850    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  73.45 
 
 		 599 aa  902    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 		 600 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 		 608 aa  628  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  53.55 
 
 		 593 aa  630  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  53.78 
 
 		 595 aa  628  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  52.09 
 
 		 610 aa  627  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 		 602 aa  628  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.42 
 
 		 598 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  51.68 
 
 		 604 aa  628  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 		 599 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 		 598 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.25 
 
 		 601 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 606 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 616 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  53.03 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 		 601 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  52.05 
 
 		 596 aa  619  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  52.1 
 
 		 608 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 601 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  52.67 
 
 		 632 aa  618  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 		 596 aa  616  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  52.67 
 
 		 605 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  52.08 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  53.16 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.12 
 
 		 596 aa  612  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 609 aa  612  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  52.45 
 
 		 600 aa  614  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 603 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  52.81 
 
 		 599 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  52.94 
 
 		 595 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 613 aa  610  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  51.56 
 
 		 613 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 610 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  52.66 
 
 		 608 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  609  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  52.21 
 
 		 600 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  51.91 
 
 		 604 aa  611  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  52.82 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  51.74 
 
 		 603 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 606 aa  611  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  51.88 
 
 		 597 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  51.59 
 
 		 607 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  50.75 
 
 		 605 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 627 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  50.91 
 
 		 606 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  50.92 
 
 		 598 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  51.11 
 
 		 592 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  52.42 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 609 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  51.09 
 
 		 607 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 607 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4397  GTP-binding protein  51.42 
 
 		 607 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5317  GTP-binding protein  51.09 
 
 		 607 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.818778  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  51.44 
 
 		 598 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  51.09 
 
 		 607 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  52.1 
 
 		 598 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  51.09 
 
 		 607 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  51.54 
 
 		 597 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  51.09 
 
 		 607 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  50.94 
 
 		 596 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  51.09 
 
 		 607 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  50.67 
 
 		 605 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  51.34 
 
 		 598 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  51.09 
 
 		 607 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>