More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2688 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  76.67 
 
 		 604 aa  949    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  65.11 
 
 		 599 aa  826    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 		 605 aa  650    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 		 608 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  52 
 
 		 603 aa  635    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 		 606 aa  657    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  68.41 
 
 		 598 aa  846    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  53.88 
 
 		 608 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  53 
 
 		 602 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  54.05 
 
 		 608 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  78.61 
 
 		 604 aa  983    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  54.24 
 
 		 602 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 		 614 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  56.17 
 
 		 611 aa  678    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  67.68 
 
 		 604 aa  828    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 		 608 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  100 
 
 		 602 aa  1227    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  71.31 
 
 		 599 aa  889    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  53.88 
 
 		 608 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 		 610 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  69.58 
 
 		 598 aa  865    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 		 608 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  69.28 
 
 		 601 aa  859    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  54.21 
 
 		 608 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  54.02 
 
 		 596 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.27 
 
 		 598 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 600 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 		 598 aa  631  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 		 608 aa  630  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  53.75 
 
 		 599 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  54.25 
 
 		 596 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 		 597 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 		 600 aa  626  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 		 608 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 		 593 aa  627  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  53.07 
 
 		 596 aa  625  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  52.09 
 
 		 604 aa  625  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  51.1 
 
 		 614 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  50.25 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  50.25 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 		 610 aa  622  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  52.81 
 
 		 600 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 601 aa  624  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 614 aa  621  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 		 603 aa  620  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  51.88 
 
 		 596 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 599 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 		 610 aa  618  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 610 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  51.32 
 
 		 610 aa  618  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 614 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 597 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  49.26 
 
 		 614 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  51.25 
 
 		 603 aa  617  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 606 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 601 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 		 602 aa  615  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  52.85 
 
 		 605 aa  617  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 601 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 597 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  52.36 
 
 		 616 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 632 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  50.99 
 
 		 613 aa  614  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  51.94 
 
 		 598 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 		 613 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  49.33 
 
 		 608 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  51.94 
 
 		 598 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  51.02 
 
 		 592 aa  614  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 609 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  52.02 
 
 		 595 aa  613  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  51 
 
 		 598 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 605 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 609 aa  612  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  51.92 
 
 		 613 aa  610  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  51.19 
 
 		 598 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  51.02 
 
 		 598 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  51.71 
 
 		 597 aa  610  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  52.69 
 
 		 595 aa  609  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1250  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 609 aa  610  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0809475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  51.26 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  48.5 
 
 		 603 aa  610  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 		 616 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  51.19 
 
 		 600 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 		 605 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>