More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0864 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  51.97 
 
 		 616 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  51.98 
 
 		 613 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  53.2 
 
 		 615 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 		 616 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1761  small GTP-binding protein  64.4 
 
 		 634 aa  809    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  52.67 
 
 		 602 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  70.33 
 
 		 613 aa  917    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  71.6 
 
 		 614 aa  904    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  54.14 
 
 		 605 aa  670    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 		 614 aa  661    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  52.87 
 
 		 615 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  51.47 
 
 		 620 aa  641    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  56.09 
 
 		 608 aa  698    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  56.42 
 
 		 605 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 619 aa  1258    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  53.04 
 
 		 615 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  71.48 
 
 		 612 aa  905    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  52.91 
 
 		 606 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  70.18 
 
 		 608 aa  885    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  56.42 
 
 		 594 aa  662    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 		 594 aa  658    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  54.08 
 
 		 608 aa  654    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  71.59 
 
 		 613 aa  887    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 605 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 632 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 603 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  52.51 
 
 		 630 aa  632  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 610 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 		 610 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 		 610 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 608 aa  625  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 		 610 aa  627  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 604 aa  624  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  52.72 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  51.43 
 
 		 603 aa  624  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 		 617 aa  624  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  53.21 
 
 		 605 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  51.37 
 
 		 630 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 		 607 aa  623  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 606 aa  621  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  52.39 
 
 		 610 aa  619  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  52.1 
 
 		 617 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  50.82 
 
 		 620 aa  618  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  52.61 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  52.85 
 
 		 621 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  50.64 
 
 		 629 aa  617  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 		 608 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 		 613 aa  616  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 617 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  52.47 
 
 		 614 aa  617  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  52.52 
 
 		 607 aa  618  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  52.73 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  52.35 
 
 		 607 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 598 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  51.83 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 608 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 		 605 aa  613  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 601 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  52.26 
 
 		 614 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  52.38 
 
 		 609 aa  611  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  49.5 
 
 		 610 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 608 aa  612  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  53.25 
 
 		 593 aa  613  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 606 aa  612  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  52.35 
 
 		 607 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 606 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 606 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 599 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  52 
 
 		 605 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 620 aa  611  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  51.17 
 
 		 606 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  51.64 
 
 		 610 aa  609  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 627 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  51.39 
 
 		 624 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 601 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 606 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  50.82 
 
 		 609 aa  608  9.999999999999999e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  52.27 
 
 		 610 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 608 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1426  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 608 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0201967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  50.51 
 
 		 598 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 608 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 		 608 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  52.28 
 
 		 614 aa  608  9.999999999999999e-173  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  52.28 
 
 		 595 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1215  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378082  normal  0.59958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 612 aa  607  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 607 aa  608  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 608 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 606 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>