More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2287 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  52.57 
 
 
607 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  52.57 
 
 
607 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  54.58 
 
 
604 aa  668    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  56.86 
 
 
598 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 
606 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  54.37 
 
 
600 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 
615 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  54.91 
 
 
606 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  50.99 
 
 
609 aa  641    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  53.99 
 
 
606 aa  663    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  53.81 
 
 
614 aa  681    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 
605 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  80.63 
 
 
602 aa  1009    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  53.07 
 
 
613 aa  661    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  53.08 
 
 
608 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  54.41 
 
 
603 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 
606 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  53.81 
 
 
614 aa  681    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  53.81 
 
 
614 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  52.75 
 
 
607 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  53.81 
 
 
614 aa  679    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 
608 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  52.91 
 
 
608 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  52.91 
 
 
608 aa  652    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 
606 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  52.88 
 
 
615 aa  654    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 
613 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 
598 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 
606 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 
608 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  53.55 
 
 
610 aa  682    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  55.29 
 
 
600 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.99 
 
 
596 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 
608 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  55.32 
 
 
609 aa  673    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  53.82 
 
 
606 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  54.32 
 
 
606 aa  664    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  56.76 
 
 
602 aa  710    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  54.09 
 
 
608 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  53.1 
 
 
610 aa  660    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  54.89 
 
 
600 aa  667    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 
608 aa  656    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 
602 aa  662    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  57.19 
 
 
598 aa  711    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  56.57 
 
 
601 aa  708    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 
607 aa  654    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  53.81 
 
 
614 aa  681    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  75.13 
 
 
600 aa  925    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  55.54 
 
 
598 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  57.12 
 
 
597 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 
603 aa  669    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  54.15 
 
 
603 aa  670    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 
608 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  54.68 
 
 
592 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
608 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  50.92 
 
 
615 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  80.47 
 
 
602 aa  1007    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  55.88 
 
 
598 aa  679    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  54.71 
 
 
614 aa  675    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  53.71 
 
 
606 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  56.34 
 
 
596 aa  669    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 
606 aa  653    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  53.91 
 
 
609 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  52.84 
 
 
608 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  54.68 
 
 
598 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  55.11 
 
 
602 aa  678    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  80.47 
 
 
602 aa  1008    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 
608 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 
603 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2008  GTP-binding protein TypA  51.66 
 
 
607 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 
608 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 
608 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  53.38 
 
 
615 aa  654    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
607 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 
605 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 
593 aa  654    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  53.82 
 
 
606 aa  656    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  53.73 
 
 
610 aa  650    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 
608 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  54.85 
 
 
623 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  53.24 
 
 
608 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  57.05 
 
 
610 aa  693    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  57.05 
 
 
610 aa  691    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  56.54 
 
 
614 aa  703    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  55.14 
 
 
596 aa  674    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  54.24 
 
 
603 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  54.24 
 
 
603 aa  658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  55.67 
 
 
602 aa  684    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  53.9 
 
 
603 aa  657    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  55.91 
 
 
608 aa  686    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  53.92 
 
 
608 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  54.74 
 
 
605 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  52.99 
 
 
613 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0807  stress response membrane GTPase  50.17 
 
 
611 aa  649    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0319085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  54.32 
 
 
606 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1342  stress response membrane GTPase  50.5 
 
 
613 aa  645    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0910775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  52.81 
 
 
615 aa  658    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 
608 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  52 
 
 
610 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  54.08 
 
 
611 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>