More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1470 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 		 616 aa  683    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  52.49 
 
 		 603 aa  645    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  54.05 
 
 		 608 aa  669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1470  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 607 aa  1229    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  58.33 
 
 		 605 aa  714    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  61.98 
 
 		 608 aa  778    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  52.84 
 
 		 608 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 613 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 602 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  51.66 
 
 		 610 aa  648    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 		 608 aa  659    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  53.55 
 
 		 607 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  54.52 
 
 		 608 aa  663    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  53.15 
 
 		 608 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  51.77 
 
 		 592 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  53.21 
 
 		 594 aa  635    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 		 614 aa  647    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  53.11 
 
 		 608 aa  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  52.68 
 
 		 608 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 		 608 aa  648    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  59.54 
 
 		 606 aa  733    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  52.61 
 
 		 605 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  57.05 
 
 		 614 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 		 614 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  59.73 
 
 		 610 aa  725    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  60.07 
 
 		 610 aa  727    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  54.04 
 
 		 610 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  53.05 
 
 		 608 aa  664    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  52.36 
 
 		 612 aa  660    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  51.17 
 
 		 609 aa  633  1e-180  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  51.73 
 
 		 614 aa  632  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  51.73 
 
 		 614 aa  633  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  51.73 
 
 		 614 aa  633  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  51.73 
 
 		 614 aa  633  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  51.73 
 
 		 614 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  51.73 
 
 		 614 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  51.73 
 
 		 614 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  51.89 
 
 		 614 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  51.73 
 
 		 614 aa  633  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  51.92 
 
 		 604 aa  634  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 		 596 aa  632  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 615 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 614 aa  631  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1081  GTP-binding protein  50.17 
 
 		 622 aa  629  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00893132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 615 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  49.67 
 
 		 615 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 609 aa  628  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 607 aa  627  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 614 aa  625  1e-178  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  52.52 
 
 		 613 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 627 aa  627  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 600 aa  626  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 601 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  51.91 
 
 		 605 aa  625  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 615 aa  621  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 607 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 		 598 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  50.67 
 
 		 610 aa  624  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 615 aa  621  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 616 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 598 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 615 aa  619  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  50.99 
 
 		 601 aa  621  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 614 aa  620  1e-176  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 614 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  51.79 
 
 		 597 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 608 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 599 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 608 aa  618  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 608 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 		 632 aa  618  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 605 aa  618  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 593 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 606 aa  615  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  50.91 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 602 aa  615  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  49.67 
 
 		 622 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  51.32 
 
 		 613 aa  616  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  50.91 
 
 		 601 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5317  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.818778  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  50.91 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>