More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0603 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0603  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
619 aa  1263    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.212594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.64 
 
 
598 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  52.21 
 
 
610 aa  625  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  50.49 
 
 
598 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  50.73 
 
 
601 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 
600 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  49.1 
 
 
602 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  50.82 
 
 
599 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  48.94 
 
 
602 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  49.84 
 
 
601 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  51.39 
 
 
605 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 
610 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  49.84 
 
 
601 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  51.14 
 
 
606 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  48.61 
 
 
602 aa  611  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  50.99 
 
 
610 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  51.55 
 
 
608 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  49.67 
 
 
600 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  51.79 
 
 
606 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4267  GTP-binding protein TypA  50.16 
 
 
615 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0798314 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  51.96 
 
 
632 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  51.96 
 
 
605 aa  605  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  50.49 
 
 
610 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  49.51 
 
 
602 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  51.63 
 
 
606 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  47.96 
 
 
608 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  49.76 
 
 
605 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  48.29 
 
 
602 aa  605  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  52.05 
 
 
606 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  51.06 
 
 
606 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  50.65 
 
 
613 aa  600  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  51.63 
 
 
606 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  51.88 
 
 
607 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  52.37 
 
 
602 aa  595  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  52.93 
 
 
609 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  50.81 
 
 
608 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  50.16 
 
 
614 aa  597  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  50.81 
 
 
608 aa  598  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 
592 aa  596  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  50.81 
 
 
608 aa  598  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  48.79 
 
 
614 aa  595  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  48.79 
 
 
614 aa  598  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  49.1 
 
 
602 aa  595  1e-169  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  46.73 
 
 
604 aa  592  1e-168  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  47.95 
 
 
608 aa  592  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  48.23 
 
 
614 aa  592  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0412  GTP-binding protein TypA  51.47 
 
 
607 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  50.57 
 
 
627 aa  594  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  51.63 
 
 
606 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 
608 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  50.56 
 
 
614 aa  594  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  50 
 
 
606 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  50.49 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 
603 aa  593  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  48.23 
 
 
614 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  48.37 
 
 
600 aa  593  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  49.84 
 
 
606 aa  595  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  50.24 
 
 
606 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  51.3 
 
 
605 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  50.49 
 
 
608 aa  592  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  50.49 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  50.33 
 
 
605 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  48.23 
 
 
614 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  52.37 
 
 
602 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
608 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
606 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  48.23 
 
 
614 aa  591  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  48.23 
 
 
614 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  48.23 
 
 
614 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  48.23 
 
 
614 aa  591  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  48.23 
 
 
614 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
607 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  51.72 
 
 
607 aa  592  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  48.23 
 
 
614 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  51.71 
 
 
602 aa  592  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  50.24 
 
 
606 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  48.45 
 
 
602 aa  589  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  51.47 
 
 
611 aa  588  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  49.27 
 
 
609 aa  590  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  49.67 
 
 
609 aa  587  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 
606 aa  586  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 
602 aa  588  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 
597 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  49.1 
 
 
603 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  50 
 
 
605 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  50.65 
 
 
627 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  48.85 
 
 
607 aa  585  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
606 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
608 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
607 aa  588  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 
597 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>