More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3360 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3360  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 607 aa  1244    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0722  GTP-binding protein TypA  60.99 
 
 		 611 aa  748    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 616 aa  616  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 		 614 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  50.91 
 
 		 601 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 601 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 602 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 598 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 605 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 		 599 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 610 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 600 aa  598  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  48.91 
 
 		 597 aa  595  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  48.66 
 
 		 596 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  48.58 
 
 		 598 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 605 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  48.09 
 
 		 606 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 632 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 		 601 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  48.98 
 
 		 602 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  46.94 
 
 		 612 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  47.58 
 
 		 603 aa  581  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  47.74 
 
 		 599 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  47.05 
 
 		 614 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  47.21 
 
 		 614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  47.21 
 
 		 614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  47.21 
 
 		 614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 		 608 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  47.95 
 
 		 610 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  48.63 
 
 		 600 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  47.21 
 
 		 614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  47.21 
 
 		 614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  47.21 
 
 		 614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  47.38 
 
 		 614 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  47.91 
 
 		 613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  47.38 
 
 		 614 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  47.05 
 
 		 614 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  47.05 
 
 		 614 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  48.36 
 
 		 613 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  48.14 
 
 		 597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  48.64 
 
 		 597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4267  GTP-binding protein TypA  46.76 
 
 		 615 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0798314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  48.25 
 
 		 605 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  47.43 
 
 		 610 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  47.43 
 
 		 610 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1761  small GTP-binding protein  49 
 
 		 634 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  47.4 
 
 		 608 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  47.35 
 
 		 618 aa  574  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 		 608 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  48.14 
 
 		 597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  48.28 
 
 		 607 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  48.28 
 
 		 607 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  47.87 
 
 		 600 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4397  GTP-binding protein  48.28 
 
 		 607 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  47.67 
 
 		 604 aa  568  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  48.28 
 
 		 607 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  46.92 
 
 		 603 aa  570  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  47.01 
 
 		 614 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  48.98 
 
 		 596 aa  570  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  48.81 
 
 		 600 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  47.52 
 
 		 608 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  48.28 
 
 		 607 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  49.17 
 
 		 615 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  47.58 
 
 		 608 aa  568  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  48.34 
 
 		 609 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  48.09 
 
 		 607 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  47.95 
 
 		 598 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  48.85 
 
 		 609 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  47.95 
 
 		 598 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  47.95 
 
 		 598 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  47.69 
 
 		 608 aa  566  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  48.59 
 
 		 610 aa  567  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  47.95 
 
 		 598 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  46.95 
 
 		 596 aa  567  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  49.17 
 
 		 615 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  48.11 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  48.11 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  48.11 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  46.72 
 
 		 613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  47.78 
 
 		 598 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  48.11 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.64 
 
 		 596 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  47.52 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  47.68 
 
 		 610 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  48.1 
 
 		 603 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  48.84 
 
 		 615 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  48.11 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  48.11 
 
 		 607 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  48.11 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  47.37 
 
 		 610 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  47.68 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  48.11 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  47.68 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  46.78 
 
 		 608 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  47.52 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  47.52 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5317  GTP-binding protein  48.11 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.818778  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  47.68 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  47.22 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>