More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0722 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0722  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
611 aa  1259    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3360  GTP-binding protein TypA  60.99 
 
 
607 aa  748    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 
614 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 
605 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 
602 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  48.84 
 
 
608 aa  601  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 
616 aa  601  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  48.77 
 
 
608 aa  601  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  48.77 
 
 
608 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 
598 aa  598  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 
606 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  48.52 
 
 
608 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 
601 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  48.68 
 
 
603 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  48.44 
 
 
608 aa  595  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  48.11 
 
 
610 aa  595  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 
610 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 
601 aa  592  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  49.33 
 
 
599 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  49 
 
 
608 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  49.17 
 
 
613 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  48.84 
 
 
598 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  48.93 
 
 
609 aa  587  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  50.34 
 
 
592 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 
627 aa  585  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  49.27 
 
 
614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 
596 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  48.62 
 
 
632 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  48.85 
 
 
605 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  48.93 
 
 
608 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4267  GTP-binding protein TypA  48 
 
 
615 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0798314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 
614 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 
601 aa  579  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  49.26 
 
 
606 aa  576  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  48.09 
 
 
605 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  49.66 
 
 
608 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  48.43 
 
 
606 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  48.6 
 
 
606 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  48.32 
 
 
608 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 
597 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  49.17 
 
 
604 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  48.51 
 
 
614 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  49.17 
 
 
613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 
597 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  48.43 
 
 
606 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  48.82 
 
 
596 aa  576  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  49.25 
 
 
605 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  48.34 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  48.34 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 
609 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  48.34 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  48.76 
 
 
603 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 
603 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  48.34 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  48.34 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  48.34 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  48.34 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  48.51 
 
 
606 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  48.92 
 
 
605 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  48.68 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  48.34 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  48.99 
 
 
597 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  48.51 
 
 
614 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  48.68 
 
 
606 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 
603 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 
603 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 
603 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  49.17 
 
 
605 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 
603 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  49.26 
 
 
609 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 
606 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  48.52 
 
 
608 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  48.52 
 
 
608 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0312  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 
603 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  48.54 
 
 
615 aa  570  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  49.17 
 
 
603 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  48.52 
 
 
608 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 
609 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 
607 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  48.68 
 
 
608 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  48.52 
 
 
608 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  47.38 
 
 
600 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 
603 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  48.69 
 
 
609 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  48.44 
 
 
608 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  49.01 
 
 
606 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  47.78 
 
 
604 aa  571  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  49.26 
 
 
609 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  48.52 
 
 
608 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  48.11 
 
 
615 aa  571  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  49.16 
 
 
597 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  48.93 
 
 
611 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  48.52 
 
 
608 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  45.85 
 
 
599 aa  565  1e-160  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  47.76 
 
 
615 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  47.39 
 
 
613 aa  566  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  45.35 
 
 
608 aa  567  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  46.57 
 
 
599 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  47.95 
 
 
608 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  48.44 
 
 
608 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>