More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0573 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 
602 aa  639    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.68 
 
 
598 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  55.56 
 
 
597 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  53.16 
 
 
601 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  53.65 
 
 
602 aa  640    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4397  GTP-binding protein  52.91 
 
 
607 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  53.78 
 
 
599 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 
602 aa  637    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.01 
 
 
599 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 
608 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  53.15 
 
 
616 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  52.91 
 
 
607 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  54.05 
 
 
608 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  54.55 
 
 
608 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 
608 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0573  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
612 aa  1251    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.179658 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  52.08 
 
 
602 aa  639    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 
598 aa  635    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 
602 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  53.81 
 
 
610 aa  651    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 
608 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  53.82 
 
 
609 aa  651    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 
606 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 
608 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  52.82 
 
 
602 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  53.88 
 
 
608 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  53.49 
 
 
601 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  53.82 
 
 
600 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  52.91 
 
 
607 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  54.36 
 
 
602 aa  646    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 
598 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 
608 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  52.76 
 
 
607 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  54.21 
 
 
608 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 
600 aa  639    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  53.68 
 
 
598 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  55.21 
 
 
597 aa  642    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  53.28 
 
 
603 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 
601 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  55 
 
 
608 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 
608 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 
605 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.85 
 
 
614 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  54.1 
 
 
598 aa  645    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  52.91 
 
 
607 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  51.33 
 
 
600 aa  635    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  54.85 
 
 
602 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 
608 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  53.88 
 
 
608 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  55.21 
 
 
597 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.66 
 
 
605 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  53.77 
 
 
598 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  55.21 
 
 
597 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 
600 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 
608 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  54.78 
 
 
600 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  54.05 
 
 
608 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  52.51 
 
 
602 aa  638    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  52.91 
 
 
607 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  53.49 
 
 
605 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  54.05 
 
 
608 aa  646    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  54.87 
 
 
596 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  52.58 
 
 
609 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  53.51 
 
 
602 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  52.66 
 
 
608 aa  639    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  54.05 
 
 
608 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  53.32 
 
 
605 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  53.82 
 
 
602 aa  644    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  54.05 
 
 
608 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  53.08 
 
 
607 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  53.08 
 
 
607 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  54.02 
 
 
600 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0487  GTP-binding protein TypA  52.31 
 
 
609 aa  633  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5317  GTP-binding protein  53.08 
 
 
607 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.818778  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0552  GTP-binding elongation factor protein  52.31 
 
 
609 aa  632  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  53.08 
 
 
607 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  53.08 
 
 
607 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  53.5 
 
 
598 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  53.92 
 
 
596 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  53.08 
 
 
607 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  53.08 
 
 
607 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  53.48 
 
 
606 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  53.48 
 
 
606 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  53.08 
 
 
607 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  53.08 
 
 
607 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 
632 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  52.91 
 
 
607 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 
602 aa  634  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
609 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  52.5 
 
 
610 aa  633  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  51.5 
 
 
609 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  51.89 
 
 
608 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  51.89 
 
 
608 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  53.5 
 
 
606 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 
603 aa  630  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 
603 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 
603 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  51.91 
 
 
607 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  53.16 
 
 
606 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  53.08 
 
 
605 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>