More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2939 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  74.5 
 
 		 607 aa  931    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  74.5 
 
 		 607 aa  931    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  62.94 
 
 		 608 aa  761    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  56.95 
 
 		 598 aa  679    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  68.38 
 
 		 606 aa  838    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  78.54 
 
 		 604 aa  993    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  56.05 
 
 		 615 aa  693    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  68.77 
 
 		 606 aa  859    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 615 aa  684    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  64.11 
 
 		 606 aa  761    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  54.89 
 
 		 614 aa  682    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  75.66 
 
 		 605 aa  946    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  54.85 
 
 		 602 aa  661    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  53.57 
 
 		 613 aa  659    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  73.55 
 
 		 607 aa  924    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  78.54 
 
 		 603 aa  986    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  69.6 
 
 		 606 aa  844    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  54.89 
 
 		 614 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  54.89 
 
 		 614 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  54.89 
 
 		 614 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  62.94 
 
 		 608 aa  761    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  67.11 
 
 		 608 aa  845    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  67.11 
 
 		 608 aa  845    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  69.44 
 
 		 606 aa  837    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  66.06 
 
 		 615 aa  822    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  59.9 
 
 		 613 aa  730    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  58.17 
 
 		 601 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  68.21 
 
 		 606 aa  838    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  62.94 
 
 		 606 aa  753    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  62.94 
 
 		 608 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  60.56 
 
 		 610 aa  745    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  69.05 
 
 		 606 aa  861    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0153  GTP-binding protein TypA  61.79 
 
 		 605 aa  775    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  62.94 
 
 		 608 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  67.44 
 
 		 609 aa  848    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  67.72 
 
 		 606 aa  835    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  67.72 
 
 		 606 aa  843    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 602 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  62.27 
 
 		 608 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3380  GTP-binding protein TypA  58.61 
 
 		 608 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465428  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  81.44 
 
 		 609 aa  1023    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  63.11 
 
 		 608 aa  762    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  55.22 
 
 		 614 aa  687    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  56.95 
 
 		 598 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  53.07 
 
 		 606 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  67.11 
 
 		 607 aa  837    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  54.89 
 
 		 614 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  53.08 
 
 		 600 aa  646    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 615 aa  684    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  77.04 
 
 		 609 aa  973    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  62.44 
 
 		 603 aa  763    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  87.58 
 
 		 607 aa  1105    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  77.04 
 
 		 609 aa  973    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2746  GTP-binding protein TypA  57.03 
 
 		 607 aa  681    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.163334  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  62.94 
 
 		 608 aa  760    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  58.28 
 
 		 609 aa  700    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  53.16 
 
 		 602 aa  642    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  78.31 
 
 		 607 aa  991    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  62.27 
 
 		 605 aa  743    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  58.5 
 
 		 610 aa  694    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 614 aa  649    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2137  GTP-binding protein TypA  59.27 
 
 		 607 aa  705    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  69.54 
 
 		 608 aa  864    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  78.54 
 
 		 603 aa  987    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  61.87 
 
 		 602 aa  739    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2429  GTP-binding protein TypA  59.11 
 
 		 607 aa  695    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.456233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  63.11 
 
 		 608 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  77.08 
 
 		 603 aa  980    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  55.02 
 
 		 602 aa  663    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  65.18 
 
 		 608 aa  827    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 627 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  66.39 
 
 		 615 aa  826    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  63.44 
 
 		 607 aa  752    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  56.76 
 
 		 599 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  63.11 
 
 		 608 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  53.9 
 
 		 614 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  62.94 
 
 		 608 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  62.44 
 
 		 608 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  80.2 
 
 		 623 aa  1021    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  68.11 
 
 		 605 aa  858    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  68.22 
 
 		 603 aa  852    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  54.44 
 
 		 610 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  54.44 
 
 		 610 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0417  GTP-binding protein  72.67 
 
 		 616 aa  887    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  53.96 
 
 		 596 aa  636    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  77.87 
 
 		 603 aa  981    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  77.87 
 
 		 603 aa  981    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  68.67 
 
 		 602 aa  864    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  76.87 
 
 		 603 aa  972    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  63.8 
 
 		 608 aa  818    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  62.27 
 
 		 608 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  67.77 
 
 		 605 aa  849    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  53.71 
 
 		 613 aa  658    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  51.99 
 
 		 618 aa  640    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  66.61 
 
 		 615 aa  828    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  54.55 
 
 		 615 aa  665    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  62.44 
 
 		 608 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2008  GTP-binding protein TypA  58.94 
 
 		 607 aa  696    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  65.06 
 
 		 611 aa  829    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  78.7 
 
 		 603 aa  989    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>