More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16140 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_16140  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 366 aa  754    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.943071  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31578  predicted protein  54.25 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.667857  normal  0.0330818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  44.23 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02733  uroporphyrinogen decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_1G05060)  38.87 
 
 		 363 aa  232  9e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00030  uroporphyrinogen decarboxylase, putative  37.67 
 
 		 380 aa  229  6e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000569927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46716  uroporphyrinogen decarboxylase  36.07 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00457298 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  35.93 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  36.19 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  35.54 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  37.02 
 
 		 355 aa  219  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  34.65 
 
 		 341 aa  218  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1502  uroporphyrinogen decarboxylase  35.39 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  35.38 
 
 		 352 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  35.91 
 
 		 354 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  35.91 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1681  uroporphyrinogen decarboxylase  34.96 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  34.72 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  34.63 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  34.82 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  35.18 
 
 		 354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  35.54 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  34.81 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  36.03 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  35.46 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  37.64 
 
 		 355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  34.07 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  34.35 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  34.9 
 
 		 354 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  34.63 
 
 		 354 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3491  uroporphyrinogen decarboxylase  35.56 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000153179  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  34.9 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  35.16 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  36.57 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  35.91 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  35.56 
 
 		 363 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  36.54 
 
 		 355 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  36.71 
 
 		 354 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  35.56 
 
 		 354 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0028  uroporphyrinogen decarboxylase  36.07 
 
 		 369 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  32.68 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  35.83 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  34.34 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  35.93 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  35.26 
 
 		 356 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  36.39 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  36.74 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  35.16 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  34.34 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  37.02 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  33.24 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  32.51 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  36.84 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  35.08 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  36.74 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  36.74 
 
 		 354 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  35.36 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  36.39 
 
 		 354 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  36.19 
 
 		 354 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  33.7 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  32.6 
 
 		 351 aa  206  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  35.83 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  35.28 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  35.83 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  34.81 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  35.83 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  35.83 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  35.28 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  35.56 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  33.8 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  35.08 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  35.64 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  33.15 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  34.81 
 
 		 355 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  33.89 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  34.99 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  35.18 
 
 		 354 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  33.61 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  35.28 
 
 		 354 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  36.11 
 
 		 355 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  32.87 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  33.61 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0774  uroporphyrinogen decarboxylase  35.21 
 
 		 344 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  35.28 
 
 		 354 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  35.28 
 
 		 354 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  35.28 
 
 		 354 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  35.56 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  33.79 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  33.79 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  36.11 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  36.11 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  33.79 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>