More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31578 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009359  OSTLU_31578  predicted protein  100 
 
 		 362 aa  744    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.667857  normal  0.0330818 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16140  uroporphyrinogen decarboxylase  54.25 
 
 		 366 aa  398  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.943071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  41.19 
 
 		 353 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46716  uroporphyrinogen decarboxylase  36.36 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00457298 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02733  uroporphyrinogen decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_1G05060)  35.77 
 
 		 363 aa  223  6e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00030  uroporphyrinogen decarboxylase, putative  36.12 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000569927  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1502  uroporphyrinogen decarboxylase  35.08 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1681  uroporphyrinogen decarboxylase  35.36 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  37.85 
 
 		 355 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  34.47 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  35.23 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  35.96 
 
 		 368 aa  210  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  35.98 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  34.81 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  33.43 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  34.07 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  34.93 
 
 		 356 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  36.49 
 
 		 350 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  32.96 
 
 		 351 aa  199  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  33.24 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  34.72 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  32.41 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  35.13 
 
 		 348 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  33.43 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  34.72 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  35.29 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  34.53 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  34.93 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  34.47 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  34.08 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  35.38 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  35.29 
 
 		 354 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  33.9 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  35.38 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  32.41 
 
 		 351 aa  192  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  34.54 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  34.72 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  34.82 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  34.54 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  33.52 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  31.86 
 
 		 351 aa  190  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  32.96 
 
 		 354 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  34.17 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  34.33 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  34.36 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  34.33 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  32.41 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  32.96 
 
 		 354 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  32.57 
 
 		 341 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  34.36 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  33.89 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  35.29 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  32.96 
 
 		 354 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  33.88 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  33.52 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  32.67 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  32.4 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  35.1 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  34.45 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  33.43 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  35.1 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  35.1 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0774  uroporphyrinogen decarboxylase  35.21 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  34.45 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  34.55 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  33.71 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  35.82 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  34.75 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  33.9 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  33.7 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  34.17 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  33.15 
 
 		 378 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  33.7 
 
 		 366 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  32.58 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  34.44 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  33.43 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  34.17 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  34.32 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  34.45 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  34.06 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3491  uroporphyrinogen decarboxylase  34.23 
 
 		 367 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000153179  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  34.23 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  32.78 
 
 		 354 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  33.33 
 
 		 354 aa  186  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  33.96 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  34.54 
 
 		 354 aa  185  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  33.43 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  32.12 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  33.89 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  32.12 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>