More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2700 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 583 aa  1201    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  50.44 
 
 		 539 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  49.65 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  50.26 
 
 		 539 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  49.65 
 
 		 542 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  50.35 
 
 		 556 aa  564  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 563 aa  556  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  49.47 
 
 		 540 aa  554  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  48.51 
 
 		 542 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  49.65 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  48.35 
 
 		 555 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  48.43 
 
 		 545 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  48.35 
 
 		 555 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  49.74 
 
 		 548 aa  521  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  49.3 
 
 		 545 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  49.13 
 
 		 545 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  48.6 
 
 		 545 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  47.28 
 
 		 555 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  46.86 
 
 		 543 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  45.49 
 
 		 541 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  45.66 
 
 		 541 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  45.83 
 
 		 541 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  49.91 
 
 		 571 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  46.5 
 
 		 542 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  44.33 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 532 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  42.68 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  45.71 
 
 		 534 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  44.21 
 
 		 567 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  44.68 
 
 		 534 aa  475  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  45.75 
 
 		 529 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  43.71 
 
 		 531 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  43.71 
 
 		 531 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  45.77 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  42.61 
 
 		 529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  46.33 
 
 		 527 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  43.64 
 
 		 538 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  43.25 
 
 		 542 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  44.82 
 
 		 534 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  44.82 
 
 		 534 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  43.5 
 
 		 538 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  42.69 
 
 		 634 aa  462  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  42.17 
 
 		 525 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0946  peptide chain release factor 3  41.57 
 
 		 530 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  44.41 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  44.68 
 
 		 531 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  43.01 
 
 		 523 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  42.96 
 
 		 528 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0791  peptide chain release factor 3  41.74 
 
 		 530 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4181  peptide chain release factor 3  43.64 
 
 		 539 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2307  peptide chain release factor 3  42.96 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  45.8 
 
 		 526 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  43.33 
 
 		 535 aa  458  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1579  peptide chain release factor 3  41.84 
 
 		 529 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5122  peptide chain release factor 3  42.98 
 
 		 531 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.535643  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 527 aa  458  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  45.73 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  42.21 
 
 		 531 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  43.73 
 
 		 530 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  43.55 
 
 		 547 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1118  peptide chain release factor 3  41.75 
 
 		 531 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950984  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  44.52 
 
 		 528 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  44.04 
 
 		 539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  46.17 
 
 		 526 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0617  peptide chain release factor 3  43.6 
 
 		 541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5540  peptide chain release factor 3  42.78 
 
 		 537 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.073692  normal  0.0734795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  43.7 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0596  peptide chain release factor 3  43.6 
 
 		 541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  44.04 
 
 		 539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  43.72 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  43.52 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  42.11 
 
 		 526 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2027  peptide chain release factor 3  43.06 
 
 		 539 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  42.31 
 
 		 531 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  43.21 
 
 		 524 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  45.32 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  43.82 
 
 		 544 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  43.51 
 
 		 539 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  45.33 
 
 		 533 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1186  peptide chain release factor 3  39.93 
 
 		 533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982949 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  45.61 
 
 		 536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5645  peptide chain release factor 3  44.1 
 
 		 538 aa  448  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  43.49 
 
 		 533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  42.88 
 
 		 541 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0645  peptide chain release factor 3  43.62 
 
 		 543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2944  peptide chain release factor 3  43.61 
 
 		 539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0217278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4062  peptide chain release factor 3  43.01 
 
 		 542 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2337  peptide chain release factor 3  43.06 
 
 		 541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.707548  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  42.86 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  46.33 
 
 		 527 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  42.88 
 
 		 541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  44.87 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  41.36 
 
 		 503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4201  peptide chain release factor 3  41.51 
 
 		 526 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.159171  normal  0.787104 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  41.58 
 
 		 526 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3016  peptide chain release factor 3  42.03 
 
 		 530 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  42.76 
 
 		 543 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  42.73 
 
 		 528 aa  445  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3586  peptide chain release factor 3  41.18 
 
 		 529 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1021  peptide chain release factor 3  42.5 
 
 		 527 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000101004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>